Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0007214 |
Located between position 6558175 and 6558279 on chromosome Gm03 strand - |
mature miRNAs for MI0007214: |
gma-miR390a-5p (MIMAT0007359): AAGCTCAGGAGGGATAGCGCC |
gma-miR390a-3p (MIMAT0007360): CGCTATCCATCCTGAGTTTC |
References |
[1]Subramanian S, Fu Y, Sunkar R, Barbazuk WB, Zhu JK, Yu O, BMC Genomics. 9:160(2008)., "Novel and nodulation-regulated microRNAs in soybean roots" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CTTATTAGTATCAAAATTATTTAGAAACTAATCATTAAATCAACAACACTTTTATTAAAAAGTTATTCTATTATCTTATG
AATTACAACCTTATTATAATTTAAATGGACATATTTATCAAAATTATAATCGTGATGTGCATTGAATATTAGACAATTCT
CTATTAAGTTAAAAATTAGAAACTTGTTTGTTTGACTAAAAATAATTTATAATCGAAAATGAATTATATATCTTATTTTT
AAATATTTATTTGATAATTTAATCAATTAGTGAAAATTAAGTTACTATCTTGAAAATATTTTTGTTTCGAGGAATAGATA
TAATTTTCATGATTAATACTACAAAACCCCAAAATTCTCAAATTAAATTATTTTTCAAATAAAAATCTCTCAAATAAAAA
TCTCTCCGTTAATCCTCTATTTCAATGAAAGGATGGTTAAGTCCAACCGGTAATTTTTAAATATAAGAAAAAGGAACCTT
TGTGCTTTTAAAATAGTTAAACAAAAAGAAAAGCTCAATTTTTTTTAAATAATATATGCAACTTTGAAACACAGACAAAT
TGTCTTTCTCATACATTCTTTTTACAAGTGAAACAATAAAAAAAAAGTTACATTTGTTTTGCATATTCAATTAAGGATAA
TGTAACAATTTTCTAAAACTGAAGTATTACCACTTTAATTGACTTTCAAGCCCAAAATTGATTTCAAAGACTTTAGTTGA
AAAAGGTTTTATTTTTAAATGTTTTTTTTTTCAAAATATATCTTTGTTAATGACATCTTATTTGTTAATCTTATTTTTAA
AATCGTTTATATGTACTATTTTGTTATAGTAAAATTAGAATCAGAGATTTAGTCCTTTTTTTATATGTACGATTGTATCA
TACTAAAATTAAAACCAAAGATCTCATGCATACTATTTAAATTCTCATCATTAGACTAGTCCTAATGACTACAATCAATT
TAACCATCACACTAAAATTAGAACCAAATATCTCATGCATACTATGTAACATCTCATCATTAGACTAGTCCTAATGACTA
CAATCAATTTAACCTCTAACATGATAATAAACAAGTCAAAGTAATTTATATGCTAGTCAAAATAGTAGCTTATAAGTTAC
TAAAGTCTTACTAAATACGTTGATAAAAAAAAAAAGTCTTACTAAATGCACTTTTTGTGCACTAATAATTTTTTTAGTTC
CTTATCTACATTAATATTAGTGACCAAATTAATTACCACACAACGATGTCATAGATAAAATTAATTAACACAGTGATTAA
AGTTAAGAATTACTCCATTTGATTTTTTGTGGTATTGTGGATCTAATTAATTGATGGTACGAACATTTTGAGCTACACAT
TTTTTTCCCTACAAGGTCCAACATTAATTGCCATGTGATATCAGTATCAAGGGCCATATGAATATTTTATTCTTCACTAG
TATAACGTACTATATATTCACAAGTGGTCCCCTCAAATAACTTCAGTCTATCAATTTGTGAGACATAAATTGTAACTTGT
AAGTGCGTGAATTTCATCTCTTATTACTTGCGCTCTACCCCTTTTTCGTCTTCTTCTCCACCTTCGCTTACCTCTTGTAA
AGCTTCATTTTTTTTTTTTTTGGTATATCTTGTAAAGCTTACCTTGAACATTCGCTTGAAAAATAAAAATAAAAAGTAAA
TTGTTAGTACGTGTGTACCCCAACTCTTTTAAATTCCAATGACAAGAATCGAATAAAAAGTGTTAATTTGTGTGGGTGGC
TATTGTGCACAAGTTGACATTTGACAACATATTTCTCTAAGTTTGATTTATACGTGAATCCCAAATTACACATGTGCAAT
GTCTAATCTAGAACCCCCACTCAAATCAAAAGGGAAACTATAGTATATCACCAACTTAAGGAGTGGGGGCAGACAAATAG
AATTGCGCAAACCTTAGCTTTAACGTTGGGCAATCTAAATCATGGGAATTTGGACTTAGACCGTAACACGAAGTTGGGAC
TAGTCAACATCTCTATTCTACCATTCCATTCCCACGTGATATAGTGGCTAAGTTCGGCTTATATTATATCAATCTTTTCT
TCTTTTTTTTTTTTGCATACAATCTTCCTCCTATCCTTGCGATGTTTGTGGATGATGCCGAGTTATATCAAGGGCTACCG
AGAATGAAAAAAAAAAAAAAAACTAGTCTTAGTTTAAAAACCATGAAGAATGGAAGTGAGAAATCGCTTGTCTTCTCAAG
AAATTCATGACATGAACCCCTTTTTTAACATCAACACAAAATTAAGAAATCAAATGAACCCTGTTTTTAACATCACAAAA
AATTAAGGGGATAAACAGTCTCTTAACTGTAATGGTTTATCATTGGGTTACATACTTTTACTTTAGTAGTGAAGCATTTG
CTTTTTATGATGAACTATAGTGAAGGAGGAAACAAAAAATCCAAACATTGTATATATCATGGATCATGATCTAATAACTT
CTAAGCATCTTGGTTACAAGCTAGAAGGAAAAGCTAGCTAGAAAACAGTTCAAGGTTTGTAAAGAGAACCATTCATTTGA
TCTTCTCTGAGTTTACTTGAACCTATATTGTAACATATATGGATAGTGTTAGCTAGAAATTAACAGATACCAAATTTTTT
TGGCTAGTCATCAACTTTTAAAACACACTTTGAAAAGAGAAAACTTTGAAGTAAATTAAAGAGTCACTCTACACAACCCA
AGAGGATTTGACACATTTTGGTTTCTACCTTTCTTCCACTTACTTCATCTTTAGGCTCTCTCTTTCACTTAGGAAAACAA
AAAGAAAAGAAAAGATGTTAGTCATTAAAATTGCCATAACAAACAAAAATGAAAGAAGTAGAACAACAAAAGAAGTAGTA
AAACTGAAAGAACCTTTGAGTAGTGTAGAGTAGTGCATGATGATTAAGACCAACAATTTTATTTTTATTTTTATTTATTT
TTCTTTTGGGGGGTTTCTCCTGAAAACTGAAGATCCATTG