miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0010579
Located between position 28532454 and 28532524 on chromosome Gm04 strand -
mature miRNAs for MI0010579:
         gma-miR2109 (MIMAT0010086): TGCGAGTGTCTTCGCCTCTG

References
[1]Wang Y, Li P, Cao X, Wang X, Zhang A, Li X, Biochem Biophys Res Commun. 378:799-803(2009)., "Identification and expression analysis of miRNAs from nitrogen-fixing soybean nodules"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
AAGACTGAATCTCTAGTATTGTTTTCTCTTGAGGATTAAGCATAGCTCTCTTTGAGGTTTTGTTATTAATATTAAATTCT
GATCAGTTTTTCCCCTTCACCAATTATTTTGTATTTGTTGCTGATATTAATCCATGCATGCTTAATGCTTGATTAATTGT
CTCTGTGCTTAACTAACGTTCATGCTTAATGGACATGTGAGAGAGATTAATTGGTATATGTGTTGCTTAATCACATAATG
ACAGTCTTGTATTAATTTTCACTTAGTAAATTAATTTCGGGTTGGATTAAGTGGTTGAACTGATTAGGTATAAATTCTCG
TAACCTAGGATAAAAGACTTGCTTTTGAATCAAGGGGAAACAACATGTTTTAGTTCTGTTATTTTTTTAATTCAAGTTTG
CTTGCTGTTTAAATTACAAAAAATGAATAAACCCTTTCATTTCATTATTGTTTTATTATTATATGTTATGAATGTTTGTT
TGATCATTGTTCACTGGGAGACGACCTAGAATCACTTTCTAGATACTGCATTTTAATGTTTATTTGATTCGCGTACGGTT
CTGATCAGTCTTTTATTGTTACTAATTTGATAATTTTTATTAAAGCATGCAAAATATTGTTATGTATTCACGTTAAATCA
ATTGTTACTTATCTTAATTCGAGTATAACTTATATAATAATTTAGAAAGTGACAGAACCACTTATATTTCTTGATTTATT
TAAGGTGAATGTTTTTCTGCTTTCATATGCAATAAAATTTAATTGTGTATCTTAATTTAATAAAGTAAAACAAAATCTAT
AACCCATAGAGGTACACATTTCACCACATACATCTTTGCCTCATTTTTCTACTTTTACCAAGCTTTTTTAAATCTATATT
TTATTCCTAAATACTTAATTATCTGGCCAAGTAACTAATATATTTTTTAAACTAGCTATCCATTTTTTGAATTTGTAGAT
TATAATATTAATTATAAACTAATTATTTAAAATGTTGGTAAACACTAACTTTTTTTTAAAAAAAAATCAACCAAATTTTT
ATTTATGGATCCAACCTTTTCTAACACAAACTATTCCTTTTCTTTTATAATCACCAATTCCTAACTCATTTGTTCTTAAG
TTATAAACTATTTTTTTCCTATGAGAGAACATGTATAATCTATAATTTATAAACTACAATTTATATCCACAACCTATCTA
TATAACAATATACACAAGTATTTTTCAATTTTGGTGCACACAATTGTTTTTGCCTCATTTTATGCCTTTAAAAGAGGCAT
GTAACAAATATTTTTTTTTATCGATATGTAGTCCATGTTAAATATTTTTGAAAACTATCCATTTTTTAATTTTAAAATTA
TACCAATTAACAATAAATATTTTAAAAACTGACCATTTTAAAAAAATAAAAAAAATATTTTTTTGAATTATGGGTCCTAT
CTATCCTAACACTCACACTACCACTTCTCTTTTCTATTTACTAATTCTAAATTCTTATCTCATTTATTCCATTTTAAGTT
AACTTACAATTAAGTTATCCAAAAATATTTTCCATCCAATAAATTTGGACTATAAGTAATCAAATTATTCTAATTTTCAA
TTTCTAATGATAAGATGCGATGATAATACCGAATGTTTTATACAAGTTTTGTCAATGCAACTATTATTGTTAATTGGGTT
TTAACAATACTTTTTGAACACAAATATTCGAATTAGAGATATTAACTCATATCTCATCACTTGTACACAAGAACAAAATA
GAATAGAATTGATATGTTAATTGAGTTTTAAGGAGAAAGAATAATATTTTACTATAAATAAGTCATTCTTTATAAGTTTT
GAAATCAAAAAATTCTTTTATGTGTTTTTTTTTTCTATTTGTATAAATTTTCAAGTATAAGATTAAACTCAACCTATGTA
CAACTCGAAAAAGTTTTTTTTTTGTTTTTATCTATAAATTTTAGCAAGTTTTTATCTATAGAGCTAATGTCTTATCTCAT
CAAAATTATTATATTATGATTCGTTTTATTTCAAATTCAAATCAAACTGATTATAATTATTCAATTCTCATATATTTTTT
CAATCTAAAATAATGACCTAATCAATTATTTTAGATTAATAAGTTTAGATAAAAAGATAAAATGGATAAATATTTTAACT
TTAACACAAAATAATATAATAGCGAAATAGAAATAGAGACGACAACATAACAGGAAGTATATAGTATAGTTAATATGAAT
ACTTTTTTCATTGAAAGAGTACAAACATATTAAATTAATTAGCATGATAAAACACGACAACCTAATAGAAATACAAATAT
GTATGTGTGATAATGCATGTGTTCCCACCAACGGATATAATTTTTTTAGTTTTAAGCACAAAATAAAATTGACTTAAAAA
CTTTATCCAGAAAAATATATTAACAAATGTTATAAATATTTTTTTTATTTGACACTTAATAAACATCTTATTTTATATTT
GAAGTAATTTTAATATATTTTAATTTAAGTTTTTTTTAAGAAAACATAAGTAATAAATCTTCTATTTTAATGAAAACATA
TAAGCAATTAAATTTGTTATTTGGAAAAGGAAAATGAATGATTAGGATACAAAAGAATAAAGGAGGAAATTTTTTTAATG
AAAGTTTGACATGTGTTATATGAGTAGCGATGGTGGAAGACTTATATATATATCAAACAGATAATAGATAGTAATAGAAT
ATATTAAATAAATCAATTATGATAAATTGATAATTATTCTTTCATATAAAAATTTAAATGAATTAAATTTTAGGGGCTCA
ATTAGATCAAAGCAAACCTCATATAAAACTTACAAAAGATTCTTTTAAATTACCTACACGAGATCTGATTTAAATTAAAT
AAAATAAATTATGACACCTTGAAGTTCTATAAATCTTCTCATTACCCCGACCTTCACTTCGCAATTAGGGTTCTCTGGTC
CTCCCGCCCCCGGTGCTGGCATTCTCAAGCCAGTGAAATC