Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0000663 |
Located between position 3511583 and 3511670 on chromosome 02 strand - |
mature miRNAs for MI0000663: |
osa-miR160a (MIMAT0000628): TGCCTGGCTCCCTGTATGCCA |
References |
[1]Reinhart BJ, Weinstein EG, Rhoades MW, Bartel B, Bartel DP, Genes Dev. 16:1616-1626(2002)., "MicroRNAs in plants" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
GTGACTTATAATTATTAAAAATGGTCATGATGCATGCATGTGATGGTATTTTGAGCAGACAGGACCTAGTGTTAGGTCAA
AGATGTTGGGCATGCTTATAGTGAAAGAAAGATTTTGTATCTTTGTTGATAGCTGTCTGATAAACTAATCAATTGTTTAA
CAATGTTTTCTGGTAAATGGTGGTCATATGTGATCTGTAAAGTGGGTGCTTTGGCCGCTCTTCCTGCAGGTTAATTTTGA
AGTCTCAAACCCCTCGAGATTAACAGTATATAGACAGATTAATTAATTAATAGACGTACGCGATGGAACAGTTCATGCCA
TTCAACAAGAAGCTAGCCAGTGTCAGTGTCAGTGTGTACAACACTATAGTAGTACTTCCATTCTTGAATCCGTCTCACTT
GAACTATAAATTACTTTGAAATTAATGATTATATTATGACGAATGAAGACTGTAACATTATATTTAGGATGCCACATATA
GTACTCGAATGATATATAATACATTTTTAAGTATTCACTATCAATTTTCTAAGGAAAGAAAAAAAACTGTCAAAGTTTAA
ACTTAAATAGTGTTAATGTCAATTATTCGAGAACAAAAGGAACATGTATAAGGCCATGTTTAGATCCCACTCTAAAAATT
TTCAACCTGTCACATCGAACGTTTGAACGTCTGCATGAAGTATTAAATATATGCTAAAAAATAATTAATTGCACAGATTG
CGATTAATTTGCGAGACGAATCTTTTAAGTCTAATTGCTCCATAATCTGACAATGCGGTGCTACGGTAAACATTTGCTAA
TGACGGATTAATTAGGCTTATTAATAAATTTGTCTCGCGGTTTACTAACGGATTCTGTAATTAGTTTTTTTATTAGTGCG
CGAACACCCCATGCGACACCCTATATAATACCCAATGTGACATGCCAAAACTTTATACTCTTGTATCTAAACAGCCCCTA
ATTAAGCTGGAGTGAACAGTAACATGAACACATGCATGGTCCAAAGCCATGATCATCAACAGTGTTGTACTCCGTACCTA
CCAATTGCTCATGGTACATCGCTTTGGGGAGCTATCTACAGACTACAGCCCTAGCTAGATCATCATAATACATCATTCTT
TTCCTTTTTTTATAACTATAATACATCACTCAGACAACACATATGTAGTCACTCACCTCTCTCTGACAGTGGGGTGCTAT
ACATAACCCGGACCCACCAGTCAGCCGCTCATGGCAGTCATAAACATATACATTGCAGATATAGCTGCACCCTGCAGCTA
GGGAGACATGGATCTTATGCCTGAGACTGACTGGTATAAGCCAAACCGGCATACTTGTAAACGAAAAATAATTTGTGAAT
AAAATTTTTATATACGTGTTCTTAGCGATTCAAAAGTAAAGGCTGAAAAATAAACTTCGATGAAAAAACTCTAAATTTAA
TGTTAAAAATTTAAATTTTGGCTGATAAGTATAAGCATAAACGAAAAGAGGGGCGTATAGTATATATGCATGGTGAGGTT
TGGTATAAAAGAATCTGGAGCTCGGCCAAGTGCTTCAGACAAAATCCACTTCACTGCAGGTCAGAGCCATCAACTTTTAC
AGTAGTCTTCACCATCTCTCTCTCTCTTTTTTCTCTCTTCTCTGTGACTCTGAGTTTGTTGTGTATGGGAGGAATTGAAG
GTGCACGCATGCGTGCAAGGCTAATTCGTTTTCTTTTTGCTCCATGTAGTCGCCATCGATCGCCATAGCCATGGCTGATC
AACAGTGCCCTATACCAGCGTAGCAGCTGGATGCTTAATTAATTATTAGCTCATAGCTGCTAATTAACTCATCAAAGCTA
GCTATAGCCTAGCTAACACGAGTAAGTAGTGCATACTAGCTAGCTCTCTCATCGTCATCATTCACCGGCCAAGCACGATA
TATCGAGATAAGAAAAAGATTATATAGAGATGCATGAGCTATATATATATATAGCCCAATATAGATGGATAGATATAGCC
ATTAGCTATATATAGAGAGAACTGGAGCTTAATTAAGAAATTCTTTCGCATGTCAATATGCCATTGGTTGCCAGGGGTGG
TGCTACTATATAATGTGGTATTACCTCCGTTTTCTTGATATATGACGCCATTGACTTTTTGATAAATGTGAATATACAAA
AAAATTAAGTCGTGATTAAAGAACATTTGATGATAAATCAAGTCACAATAAAATAAATGATAATTACATATTTTTTAGAA
TAAGACAAATGGCCAAATATATCTCAAAAAGTTAACTACGGCATATATTAAAAATAGAGGGAGTATGTTTTATTGAAAGT
GTGAAACTTTTTTTTGGAAAGACAGTGGAGTATATAGTATAGTAAAATTGCAGTGTGTAGGGCTGCTAGTACTGCTGAGC
TAGCTTAGCTATGTGTAGTGTGGCATGGCATCAAAAGCTTCATCCTTTAACCCCCTTGGGAAGTATCCTAGTGTCTTGTG
CTCCATGTCCCTTTGCACTTGCTTTCACTTTATGCCAAACAGCTAGTAGGAGGAGGTAGAGCAAGTATAAGCTGCTGAGC
TAGCAGCCATGGAGAGGAGTTGTTGTATCTTCCCTGGTCTTGCTTGCTCCATCTATAAATCCACCTTCACCTCCTTTCTT
CTACCTCAATCCTTCACACCTTTGCACTGTTCTTCACTTCTACTCCCTGAACATTTACATATAGCTGTATATATGTATCT
CTATCTCTCTAGTAGCCTTCTTGTCCTTTGCTTCAACTGTGTGTATATGCCTAGTAGCTAGCTAGCTTGTGTATGCATCA
ATATCTGGTTAAGTCATCACTAGTTCACTATATTTATCTACATGGAGCATATGGAAGGAAAGAGAGAAACATGTGTTGTA
CCTATATCTCCCTTTCTGTTCTCTTGGTTATTACTATCTTGCACTGTGATGTTTGCATGTGTGTTTATTTACACTGGATG
AGATGATGAGGTTTAGAGGTTTGTTCAGAAGCTGTGTAGT