| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0008290 |
| Located between position 9121417 and 9121546 on chromosome 07 strand + |
| mature miRNAs for MI0008290: |
| osa-miR1882c (MIMAT0007841): AGATTGCTTTCAAGGTCATTTCTT |
| References |
| [1]Zhu QH, Spriggs A, Matthew L, Fan L, Kennedy G, Gubler F, Helliwell C, Genome Res. 18:1456-1465(2008)., "A diverse set of microRNAs and microRNA-like small RNAs in developing rice grains" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
AGGTTAGTTGTGGTCATTCCTAGAGCCTTTAGTTGAGAGTATCTCGAGACATCATTATTTACGTATAGTAGTATCTAACA
TGAAATACTTATGACCGAAGGGAGTACAAGAACAACTAGATGTGTATACATTAACAAAATATATTATGAAGATATTATTC
GTAACCACATTCATATCAATAAATAATTGGATCAATTTGTGTTGCCTAAACATGCAGATACTAATCTTAAACATATCATG
TATATATAAATATATATTTGATCTACTTATCGACCATACTGGTATATCTTCTTCATAGTGTTAAATAAAAAATATTGACA
ACCTTCGATCTCCCATCTAATTTTTTTGACAAAAAATAATAGGGGTGGTCCCTATGGATATTTATATAAAAAATACTAAA
ATGTCTATATAGGGTTAGAATATACAGGAATGGAGGAGAATATTAGGGTTCGCATGCATAATTGAGTGAAAATTTGATCA
AATTCTCTAGACTTAACAACTAAATGTTGACTTAGGGCCATTTTGGTTTGCTACCAAAATGTACCGTACTATTTATTTTT
TTTAGCTTGTATGATACTTATAATTCTTTGGATTAAAGGCTATTGGTATTGCCTATAGTAGATTTGGTATCAATTTAGAA
CATTCTACACTATAATATCATAATTTGGCTCCACATTGGTAGCAAACTAAATATGAGAATGCAATCTTATGCTACTAAAT
AAGTGCGCTTATGTTTTGCAATACTAGAATTGGTAGGGTAGTGTCAAATTTCGAGTGGAAGCATTATATCATTGAAAATC
TGATGATTTCAGTAGCTTCTATATATTCCAAATTTGTCATCAGCAAGAAATTTTCCATGAATCCTCTGTTCTAGACGTTG
ATTGGTGATGATGTGATAGAATTCTAGGGAATTCCATGAATCCACACTACACTGTTAAGTGCAGGACCCCTAACATTAAA
CTCCCAAGCCAATTAACTGGACATATATCGTCTTTATTCAGCTTTCTCTTTGAATTTGGATGACCCACTTGCATAATTGG
TTGTTCCACCTATGCACACAAATCAAGGATGTATCCATTATATGGAAGATGTCCCACGGAAGGTTTACAACTAAAAAATA
ATCAGAAATGCATCATGGAAAACTATGAGTAAATCTAAATCGTACCGCAAGTCTTTTTATGAAAAACTTTCAAATGTAAC
TGTAGTATAATTGAAGTGTACCTACATTGTAACTATATTGTAACTACACTGTAACTACAATCTTACTTATATAAAACTTG
TATTTAACTATAGTTTGGTTAGCTAGTACCGGGATCATATGCGTGACCTATGTGAAAAAATTATTTCTAGCATTTTTTTC
TCTTTATGCACAAATATGCATCAATAGGGTGGCATATGCTTTGAAGCATGTTACATATCATGTGCATATAGTTTCCCCAA
ATGTAATATATATAATGTGTAGTCATCCAATGAAGGGAGCAGAGGATATAACCATGCGATGATATGCATACACAGAAAGT
ATTAGATAAGACTAGACACTCATATATTAATATTTTGCTTTTCAGGGTGATCAATCTCCATCATTCGTACACAGACAAGA
TGTAATGTAAGGCCCAAGTTGATGGATCCACTTGAAACAAAGCTTTGTGACTAGCATCAATGGAAGCAAGCTAGCTTTGT
GACTAGCATCAATGGTAGACTCTTTGGAGAAGTACATGGATTCTATTTGCTCAAAGTACCAAGCATGGTGGTCAAGTTGG
GGCTTCCAGATTTAGCTCTGCAACGCTGCATGTAGAAAAAGGCTCTAGTTCTTGCTCATTAGAGCATCACTGCAAGTGGC
ACCAGAGAAACACTACTAGCCATATATATATAATCATTGTCCTGCATGCATGCATATGGCTTCATATGTGTGGTTCATCC
TAAGATTTTCAGCTGCAGCTTACTGCATGGTTTAGTTGTTTCTGGAAAAGAGAGTTCAAATCATCTATCTATGGAATTGC
ATTTCAGTCATGCATGATCCACGTTTGGAATCCAATTTACCACTGCTGTTGGTTTAGAAATCGGTCGAAGAATTTTTTTT
TTCGCCTTTCTTATTTATACGTAATAATACATCACTTTTGACAATATAATAGGCCGATGTGCCATTGGTTTCTTTCATAT
AAGACTAAGGCTGAGTTTTAAAGTAAAGTTTGTCTTTGATTTTTAGTGGCAGTAAAACAAGATAAGTTATTATAGCACAT
AATTAATAGAGTATTAATTATTATAAATTTAAAAATTAGTCTATTTGATTTTTTAAAGAAACTTCTATATTAATTAAAAA
AGTATTTATAAAAAACATACCGTTGATAGTTCGGGAAGGTTCTCATGATAAACGAGGGAGTAGCAAAATCCAAACTCCCT
TTCAAACTCAGCCTAAAGGTTTATGGATTGTTCCTCACTGGAATAACAGTCAACATTAATACAATATAAGACATGGTTTT
GCTCCATCTATACGCGCTGTAATTTGGTGCTGATTGACCTAATTTTCTTCGAAGTGGATATGCAGCACCAGACAAATAAG
TGCTGGAAGAACTGAAGAATTATGCGTTTATTTAGTCATATGCGTTTATTAAGACTTTGTAGTGTTACAGGTGCTTGATT
TATGGAACCAAACTAAGCATTGGCTAGCCAAAATTTGGTTTGTTGTCTTTGGAAAGATGGTTCAAGATACTTGCCAAATT
CCTAGCTTTCGAGGACCACTTCGGAATGGAGGAAAAACTTAGGAATTTGAATCCTACAGGAATGGTCACAGTAGATACCT
TTGGTTCGTAGGAATGACCAAATGGGAAAAAAATAGAGTAAATTCCTTGTATACTCTTAAAAAATCACTCAATCAATTTT
ATATCTCTGAAATTATCCGATCACTTCTATACCCCCTGAAATTTCAATTTGATCCCTTATACACCCCTGCCGTTACATTT
TCCTTCATTAATGGTAGAGTACTCGGCTTTTAAGTGCGAC