Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0008295 |
Located between position 21478066 and 21478258 on chromosome 12 strand + |
mature miRNAs for MI0008295: |
osa-miR1882h (MIMAT0007846): AGATTGCTTTCAAGGTCATTTCTT |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TGCATGGATTCATCTCCTTGCAATACAGCTTGAGCCTAAGGGAAAACATTTTGCAAATATTTAGGGGTAGTAACATTTTG
CAAATATTTAGGGGTAGTAACATTTTGCAGACATATAATATTTGTTATCTCATAGCCATCATCTTTGGTTTTTATCATAA
TAGTCATCATGTTTTAATGGGATTATTGACCATTATTCATGCCAATCCAAGAGTTTAAGGAGATGTAATGGCAATCCACA
ATTGACAATACAAAGCAAAATTCTTTGAGATGTTTTAGAGTAGAGAGTAAAAAGGGCAGCATCAAGAGTACAATTTGCCC
AACAATTAACTACATTTTGTTGTGATACTTTGACATACTATGAAGATTCTATATGAAAAGCTCATGCAAAAAATGCTAAT
GAATAATGGTTGTGTTAATACTACAGTTCTGCGATAACAGGGTATTATTGATTTGCAAGTGCTGGTCATTAAAGATTCAG
GCAGTAAAGATGAAGTTGTCAATACATATATCAGATATTTATCGTATACTGTATACTTATATGCATATTTTGCTATACAG
TATCATTTTATTGTTGGGCAAAGGGAAAATAGAAAATCCAAGTTCAGTTATGCATAGCATGTCGTCAGTCTCACATATGT
TTTCTTTTCCTAATTATGCTCCTGTTTATATTTTGTTTTGACAGTTCAATGCCCCATTCATATTATTGTGTTGAGTGGAA
CTTAGAACACATATGTGATAGAATTATGCATGTTTGTTCACCATCAATCTAGCTAATTTCACCTTATCCAAAAAAAAAAT
GGAAATATTTGCTGTGTTACATTGTTGCTACCATTCCTTATATTTAGTAATGTCACGGGTGTATGTAGGATTCATCTCTG
GTTCTTACTGGTCCAAGCCGTGCAATCCTATTGATGGACCCTATTGAATTTGAAATTGAGCTAAGAGTCAAGGGGACAAG
TCCCTCCGAAGATAAGATCTTGAGCGCTGAAGCATTTGGGTATAATGGCACCGCTCAGAGACACAGATGTGGCTCACTCC
GCAGTATGTTGTTATCAGGAGCACGCAGCACATTGGAGTTCAAGTATGCTCACATTCCTGTGGCATTGGAGGCTACAATC
AAGGTCAGGATTACAGGAGGTTTAACTGATTTCTGTGGAAAGTTCATTGCACATACTGCTAGTATCAAGGAAGATGTCGT
ATTGCTGGACTCTGGAGAAGAAATGGTGGCTATCTCCCATGATGGAGCCATTCATTTCTCCCGCAGTGTGGTTGCAGTTG
AAGGAAATGGTGTGCTGACTGTTGGTGTTCATGCAAGGCAGAGTGGTGATGAGAATAACAGCTGTGATTACAAGAATTTT
ATCCCGGTAAGATGTGGACGGAGTCATGACACACTTGATGTTGGATTTTGCCAGATGAGTGTTGAAGTTGCTTGGTCGCT
CATGCTTTCATATTGAAAAAACATAGGCCCGATAATATTATATTTTGCCAAGTCTAGGCCCTGATAATTTTGCTTGCTGT
GACACAAGCTGTTTGCTCGATGGCATTGTAATATACTGATATGACAATACTTAATATTCGGTGTTAGTAGTTCATTTTTT
TAGAGAAGGCTATACGGCCCTGCTTTTTATTGCGTTCTTATAGAAAGCAATATGTCTTTATACATAGATTCAGAGATGCT
GGGGCCACCAGCTTGCCAGACACAGCACAGGAAACTGACTGTAAACACACTACCAACTACAGGACGCATAAGCAAGTGCT
ATAATAGAGAGGAGTATTATCTCTAATTCTATCCATATAATCTACTACTCATAAATAAGAAGCAATATATACAATAGGTC
ACCTCTAATACACAATACAAATACTAGTACTTCTAATACTATCACACCTAGGGCTTGTTTGGTAAAGCTCCAACTTCTAA
ATTTAGCTTCAGGAATTGGGTCTGGAGTGGAGCAGCTCCACCTCTCTAGTTCATTTTTTGAGAGTGTTTCACTCAGCTCC
ACTCCCATTTTAGGTGGAGATGAAGTCATGAAACTGTTTAGCTGAGCTTAGTTTCAAAAGAGGTGGAGCTAGAGCTGTGC
CAAACAGACCCCTATTTTGTTACTTCTAATACACACATATCAATACTTCTAATAATACTCTCACACACATATGGAGGTTC
TCTTAGTACATGAGAAGGTTGCTCAGCTATATGACACTTAGGGTCATCCAATCCTACGTGACACTCATGTCAAAAAAAAT
AAATAAATCATACGTGACACTCTTAAAACAGCACATCAAGTATTCCTGTATATCATCACTCAATCGTACGTGACACTCGT
GTTAAAAAGAAAATCGTATATGATGCTTTTAAGGACAGTACATCAATTATAGTAGTTGCTCCCAGGCTCCAAACTCCAGA
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CGTTGACAGCATCTTGTAATGCCGCCGCCATGGACTCCAGAGTAGCAACGTCATCAGGCTTCAGAAATGATTTCCACTAC
AACAGTAAGCCAATCAAACGAAAAAAGAATAATTAGAGGTGAGGAAACCATCTTATCCCTGAAGACCATGTCATGTCTAG
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AAGCAGAAAAAGTCATCAAAATCATGAGGAATTCTACTCTGGCCAAGGGCGTCTCTACAAATACACCAGGCAAATCTAGC
AACGGGGCATTTGAAACAAACTAGAAATAACTGCGCGCTTCGCTGCACCCGTCCAATATCAGAGGAGAAATAAATTTAAC
AGCATATAATTTTTTTATATAGCATGTATTTGGATCATTTACATATTAGAAATGAGCAAGGAGAAACAGTAATTGATGAA
ATAGAATTGTCTTACAAATTTCATAAATTAAACAGTGCAC