| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0010489 |
| Located between position 430432 and 430531 on chromosome 09 strand - |
| mature miRNAs for MI0010489: |
| osa-miR2055 (MIMAT0009980): TTTCCTTGGGAAGGTGGTTTC |
| References |
| [1]Lacombe S, Nagasaki H, Santi C, Duval D, Piegu B, Bangratz M, Breitler JC, Guiderdoni E, Brugidou C, Hirsch J, Cao X, Brice C, Panaud O, Karlowski WM, Sato Y, Echeverria M, BMC Plant Biol. 8:123(2008)., "Identification of precursor transcripts for 6 novel miRNAs expands the diversity on the genomic organisation and expression of miRNA genes in rice" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TATATCCTAATCCTACATGTTGCGTGTTGTTTTCATGCTATGCTGCATTTATATATTTTTGTATCATCTTTTTTTTTCTC
ACTTTTTGTGCTTTTGAATTGGGCTGTGAAAACAATAGTGGTAGGTAGATGCCAGATACATTTTTCTCCTATATAAAAAT
TTGAGCTGGTAGTGATGGCCATCAGTCATCAGTCATCCCAAGTCCCCTCTAACTCAAGACAAACTCTGTAGGATCCTCAT
GGAAAATTTGCAAAAGCCACAAACTCCTTTAGACTCTTATTTGTTTGTAGGAAATATGGGTATACCACCAGTGTACCTAG
CCAATGAAGCTGCACATTTAATGAGTATTTCTATGTTAGATCTGTCTTATGATGAAATGGAATGGTCTAGTACCTGGCAA
TCCTGCATAAACGTTCTGAGTACTGCAGAGAGGAGACTGAGACTAAAGATTATGTTAATTCATTGCTTAAAGAAATTACA
TGGATCGATTGCTTCTAATGTGGGTGGCCCTAAAAATCTCTAAAAATAACTTGGTAACTATTAAAAAAAGATACTTGATA
ACTGGAAGATAACTTATCTCTTGACTCTCAAGTCTCAACATCTGCATTTGCCGCTCGCTGTGTGTGTGGCCATCGCATTC
AAATCCCATAGCATCTGAATTGTGCTGGCGTCTGAGAATCCATTTGCCTCTGGCCACAGTAGACAGTTGTGACATGTAAG
AAAAAAGTGATCATGTAAATGCTATGCCGCTGAGCTCAAAATTAATATGCAATATCCATCATAATTTGTTTTAGAAATAC
GCACTTCAAAAATAAATTGTTTTCAGTTGACACTTTATATGAGATGGATGTTGTTCTTTCTTAGTTTTCTTTTCGTTGTT
TTTCTTTTATTTATTTTGTAAGCAGACGCCTGAGGCTCAAATTCCCTTTCTTGGGTGTTCGAATTTAGGGATAAAGGGGT
GGAATATGGGTTAGAATATCAGGTGGGGAGATGCTAACCTTCCATCTCTTTCTAATGAGTTAGGACTGTCTGGCCTTATT
CATACTCCAATCCTACTTCTTTTTGCACAAATACAAATCTATTGGCATTTCTTTGCTCTCTAAGAATCATGCAAGGAAAA
GACGGCCATTTTGAATGATATGCTGCCCTGCCATAAATTAATCTGCATTATATCACTGCAAAGGAAGTTTTTTTTAATCT
ATTTGCTTCTTTTTTGCAGTAATGCTCACAATTGATGTTTTACACTAAATTACACCCACTTGACAAGTTTGTGCACTAAA
TTAGACCCACTAAATGACACAAGACGATGCTAAGTACCGTCATTTCTTCCAATGTCTGGTAGCAAAATAAATTGCATGAT
TCTTGGTATCATCTGTACATGCCCAAAAACAAAAAAGTGCGGGCATGTCATCTTTGTTTTTCTTCATTGCAGGCTTCGGG
CCGTGTTATGAAATTTGCCGTACCAAGCTGAATTCAGCAACTTGATGCTTCATATATAACCAGAAGGGAACTGATCTTTG
TAGTTCAAGCTATAGAAAGAACTTCACCCGTAAGGGTAACCTTTTGATTTACCTTGGCTTTATGTTCCAGGCCATTTGTA
TATTAATCCAATGGTTTTTGCATGTTGCCTGCGTCCGTGGTATCACGCTTAACTGATCCATATATATAGTTTCTTGGTAA
ACTGAATGTATCAGAAACATTCAGTTTTCAAGTTTTTGTTTCTTCAATTATTCACTGTGAATACTGGAAAATGGTAGTTT
CCCATCAGTGGATAAAATTGAATGAAATTATATTTGTTCCTTGTTTTCTGTTAGCAAGCTTCAACAGTGTTTTTTTTTTT
CAAAAACTTTTTATATAGAAGCTTCTTTAAAAAAATAAAAGAAACATATTTTCAAATTTATAACAATTAATAGCTAATGG
CTTATCTCGTTTTGCGTGCCATGGAAATTTTAAACCAGAACTAAGGTTCGAACGCACCCTTATGCTATTTATCCTAATTT
ATGTTTGGACTTACTGGCACACTTGTACGTGCTATAATGGTTCAGTTGCATATTTTTTTTGAAACGAGTTCAGTTGAATA
TACAATCTTTTTATAATAGCTTGTAATGAAAACGATGTTATTAGTAGATTTGTCATGAAAAACACTTTTAATAGTCTTTA
TAATATATAACCCTAATCTCATATGCTAGTAACAGTTTTTTTTAAGGTAGTAGTACTAATTGCTAGTAACAGTTTCAGTG
CAGCTCATAGCTGAATGTAGGCTCTATCCAAGGCAACATACATGAAATCGACCTGAATCCATGGAAACAACACAAAAGTT
TACAGGAACTCAGCTTTGACAAAAGGTTGGGGGAACAAGTAAAGCACAGTAGTGAGGGCTACTTAATACTACCTAAGTAT
TAAAACAAGCCAAACGTTCATCAAAATATTGCCCTGCCAAAAAAAATGGTAGTAGGAAGGCCATAACAGGTACACAAGTT
GTGTGCATATGATACTGATCTCACTAAACATAATTTTAGCATTAAACTTAACACATGCCCAACCGTACATAACAAAAGCT
ACCAACTTTTTTTTTGGGCACCAAACTAGAGAGAAACCACTACATACTTCTAACAGGCCATAACCAGTTAACCATAGTTA
GCATGATGCCATTGTTCTCCACCAAAACAGAACAAAAGATGAAGGATGGTTGCTAGTACTAATTAAGTTTGCCATCCATA
GAGTAGCAGGCTGCCTGGTAAGAGTGTTATAGATATTAGGAGTACTAATTAAGAGGCATTTTGCAGAATCTTGCTGGAAT
TAAGCCAAAACAAAATGTTGCATCTGGTGCCTTCACTTCATCTAGCGTGCAGTGGAAGAAGTTTCTGCTGCCGCTCTCCT
AGACTTCTTTACTTTCCGTGCCTTCTTGCGTCCACTCTTGACTTTCAGCAGTTCGATATCAAAGTTGAGCCACGCGTTTG
GTGGTATGTTTCCTCTTCCAACATCACCATAGCTGAAAAC