miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0010555
Located between position 5947998 and 5948084 on chromosome 10 strand +
mature miRNAs for MI0010555:
         osa-miR2095-5p (MIMAT0010054): CTGATAATTTTACGATGAATAG
         osa-miR2095-3p (MIMAT0010055): CTTCCATTTATGATAAGTAT

References
[1]Xue LJ, Zhang JJ, Xue HW, Nucleic Acids Res. 37:916-930(2009)., "Characterization and expression profiles of miRNAs in rice seeds"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TGTCACCAGAGAGGCGAGGCGATTCTCGACGGTCGATGAAGGTCAAGATTGAGTATCGGATGACAACACCCTCACTCGTC
TAGATCTTGTGGATGTTGCTGTTGACCTGTCGCAGATGCCTCTCAAAACTATCGTGGTCCACTGATGTCTCGCATAGTTG
GTCGTGTGAGAAAAGGGTTGGAGGGGGCCACCGACGTGTTTGGGTTCACAGTCCTCACCACCGCCATTGTTGAAATATTG
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TTTAATTAGTATTAAACATCTAATATAACATGGACTTAAAATTTAGTCACTATATCAAAACACCACGCTTAAAATTCAAG
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GCCTACATTGACTATCCAACCCCAAACCGCTTTACTTTCTCATCACTTCTCGTCCCCCTTAATTAATCCCTGATTACGAG
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GGCCCCACACTCTTCTGTCCCCACCGCTCAGCGAAACACCGTAGGCGCACACGTGAAGGGTACACAGGAATGCGTCTTCT
CTGAATTCCTCTCACAATTCCTCATCTGCAAAGGAGGAGACCTCGGAGAGCCGGAGGTGGTAGCTAATGGTGGTGGAAAG
CCAACCCGCTTTGCGCCATCTCCCACTCGCCTCCCGCTCC