| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0010560 |
| Located between position 15729869 and 15730021 on chromosome 11 strand - |
| mature miRNAs for MI0010560: |
| osa-miR2100-5p (MIMAT0010064): TTCTCTCAAGTTGCCAAACAAG |
| osa-miR2100-3p (MIMAT0010065): AACCGCTGTTTAGGCGGAGTGG |
| References |
| [1]Xue LJ, Zhang JJ, Xue HW, Nucleic Acids Res. 37:916-930(2009)., "Characterization and expression profiles of miRNAs in rice seeds" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CAAATTGATGAGATCTTTGTATGGTCTGAAACAAACTACTAAGCAATAGCATGAGAAATTTGATAGAACATTTACATTTG
CAAGCCTCCAAGTCAATGAGGCAAATAAATGTGTATACTATCGCTATGGTAGGGGTGAGGGAGTTATTCTGTGCTTGTAT
GTTGATGACATACTAATATTTGAGACAAATACTGAGGTGATAAATGAGGTTAAATCATTCTGTCTCAAAGTTTCGATATG
AAGAAGTTGGGAGTAGCTGATGTTATACTAAACATTAGGAAAAGTAGGGGTGAGAATGGGATTACACTCTTGCAGTCCCA
TTATGTGGAGAAGATCTTGAATCGCTTTGGCTACATTGACAGCAAGCCTTCTCCAACACTTTATGATCCTAGCTTGCTGC
TTCGCAAGAACAAGAGAATTGCTAGGAATCAATTGGAATATTCCCAAATCATTGAACATAAGGTTGGTGCTGTTTCGTGG
AGGTCTTCACACTGGGTGGTGGTGTTGTTTCGTACCCATGTGAGTTATACTATTGTGGTAACCCAGTCTATGTGATCGGA
GATCCCGTGAATTGGATCCTGGGAAGAACAAGCCATAAGTTAACTGAAGGAGAGTACCAATATAAACCCTCTCTAAGTGA
AGATGCATGTACTCTCGTGAGCTGCAAGGCAGGTTGGCTATGCCTTAATGAGTTTTGTTGGCTTTAATTTGCGAAGATGC
TGTCCTGCAGAGCATTCTTGAAAGAACTCACCTTTGTGAGCTTGACTGTTGGTCGCAGTCTACGGAGATTTTGGATGAAT
CTTCTAGGAAGCTTACTAAAAGACCAAGGAGTATGACTTATACGCTCCAAATGAGGGGTAGTTTACAGACGGTCTAGTAT
CAGATAAGACTCTGAGTAAAATTTGCTTGCACAAGACTTGCAATGCAAGGCATAGTCCATTGTTCAAGTTGTGAGTAAGT
GTAGCTTGGAGTTCTAGATGGATGTTCAACCTTAATCGGTCTCCATCGAACCGTTGGTCTATAAAAAGTACATTGGAAAA
GGAAAATCTCAGTGAGATTTTAAGATTTGGTGGGGGATTGTTGGAATTAACAGATGGGTCTTAGTCCACTTGAAGATTAA
TTCTTTGGAAAATCACAAAAGCCCACCTCATGTGATGGTATGCATGGGGAGTTTAGTACCACCTTGCTTATTCTAGGAGA
GGGGGACCTCCTTAAAAGGGAGGATGCCTTCCTAGCCACTTGAAGCATGTGAGGTGGAGAGAAGAGGCGAACACACCCGC
GCGCTCACTCGCCTCGCCTGGTCCACCAAAATTGGTTCCTCACCCTTGCGCAGATGCAACCTCCTTTTGTAGTTTTGTTT
TGTTGTAGGAAATTCGGATTTGTTTGTTTTGGAAACATTTCGAAAAATCCGGTGCGTGAAAATGGCGTGGAGTCCGGATA
GGTTACGCGCGATTTATCCGGTTCGGTTACACGGAGTGGACATCGTGTGGACGCCCTGATCAAGCGACCTTTCTCTATAT
AAACTGAGCCGCCACCTCCATGCAACGACACAAAATCAATCTAGGGTTTGCCTCCACGCAACAACATCGTGCGGGCACCC
TGATCAAGCGCCGTCGCTCGTAGTCTACTCCATCCCGCTCGTAGGCGTGCACCGGCGATCGGGAGAGCAAGTCTCCGGAA
CCTCTACCTTCGATGTCCTGCATCGGGAGAAGGCGGCAATAATGTTTTTGGGAAGCGCTTCACGTGACTGTTCCCTGTTC
GACCACGACGGCTCATCTTCCTGTTCGTTCGCGTGCTCCATGCTGTCGTCAACGCACACAGTACCCTCGGTACGTGTTCA
ACGTGTTACACATATTTGATCTGTTCATGTTTTACTGCTTAGTTTACATGTGTAGATCTAATGATGCGTTCATGCTAGTT
TACATCTGCAATGTCATAATTTATTTATGGAATAAATTAAACCATTATGTACTTATAAATTTAAAAATCGCTGACGTATA
TCAGCACCTACAGGGGGCCACGCTAGTCAAAAATTGCTGGGGAGGGGTGAATTCCCAGCTACCTTTAATACTTTCGGTTG
CAACGTAAGACTTTTAACTTATGTGGCGAACTTATGTGGCGCTGTATTAAATGAGAGAGATGAAAAAAAAACTTGGTCTT
ATACAACACATATCTCAAAGGGAAAACCAATACACTATTGCTGCCCCCAGTTTTGGAAACAAAAAATATATTTTGTTTCC
CTATACCAACCCCTAGAATAACAGTTGGTACATACAAAAGGCTCCAAAATGTAACGTACCCAAACTCTAGACCTTTAAAA
TTTCTTGTCAAGATAGTTGAAAGATTACTTTTATATTTTTGTGAGACAAAAATTTTCATTTTAAACATAGGTGAAGATAA
AACCAACCTTTATATGTAGGAAAATGAGAGCAAAATTAAAACCTTTTTCATTTCTAACCTGAGATTAAAAAAAAGTGCAA
CCATATGTGTAATTATGCATACTTGCATAGGACATAGTTTAACTTGAGTCTTTTTTCTTGTGCATTTGTATTTTTGGTTG
GCATGGCATAATAGGTCTGATGAACATGATTAAAAGCTAACTTCACTAAGCAAACCTAAAGTCATTCTTGAGGTATAACT
TTAAAGACATGAAAATGGAGTTAAGTAATAACATGTCAGGTCAAGAGAAATCCAAATATAATTCTTATAAAATTTAGATG
CATTTATGCATTGGAAACACACATATAAAGAAAGGTCTTGCTAATTATCAAGAACAATCCATGCAAGACAAAATCATGAG
AAAATTCATGAAAGCACAAATCAATATAATCAGCTCACTATAATTTTTACTCAAATTAATATTTAAATTTCTTAGCTCAA
ATAATTCAGTCAAAGCAGTCAACTATAGGATGTAAAATTTAACTTTAATCTGCTAAAAACATAACTCACAAAAATGTGCA
TTAAACTGCATAGAAGTGTATGAGTGAAATAATTTATTCA