Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002230 |
Located between position 5751466 and 5751570 on chromosome scaffold_15 strand - |
mature miRNAs for MI0002230: |
ptc-miR166m (MIMAT0001936): TCGGACCAGGCTTCATTCCCC |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CTTTTGAAAAAAGGTCTCGTTTAAGGAATCGCTTCCTAGTATTATGGTCATTAGAAACCCTAACTTATGGGACTGGTTAC
GCAAAAGGAAAGATATTATCACCCATTAAGCGTCCTACCTGAGGTACACTGCATCGCTGGTTTTGTCTTAAATTACCAAG
AGTTTGTTGTGTTTTTATATTTGAAGATTTGCCTATAATATTCCTGACTTTGACGCCAATGAATATTCGAGTACGTATAT
TTTAAATTCTGGCATTGGTAAATATTACGTAGAAAAAAAAATGTATGATATTCCTGGCTTTGACGCAAGTGAATAAACCT
TAAAATGAATCTAAAACAAAGCATATATATTTTTTTATTTTTTATTTTAAAAAGAAAGAAAGAAAAAAAAATATAACCGA
ATTTGCATTTCACAGTAAAAATCCACAGATCAAATATACAATGAAATATTCTAAAAAAATACAAGGAACCTAAGAATAAA
TTCAAAAGGATCCATAATTTTTTTCGGAATTTTCTGATATTAAACAGGGCCTTTTTTTTTTAATCAAATATCAAAATAAG
AAGGACTAAAATAAAGGGGATTGAGGCAGCTGGGCCCGAGGCCCAGGTCAAGTTTTTTTTTTGGGCTGGGTCTGGACCAA
CCAGTACGGCCTGGGATGGACCCAGCCGGCCCAGCCCGGTCACTGGCCCACGCCAGTGACCCGTCTGGGCAGAGGAGCAC
GCATGACGCGTGCAGGTGCAGCACAGCAAAGAGTTAATTAAATCAAAGCTACAGAGCTACGTGAATTAAATTGTAAAAAC
GGGGGAAGAGATGAAAAGGGACTGACCTGCTTCAGACGCAGTTGGGGGACGAAGACCTGGGGTAGTGCTGGTCTGGGCGA
TGCTCACTCTCTGTTTATGTCTTGCCTTGTGTGATTTATGGTTTCGTGGCCTTTCTCCGTCTGTCCCTTGTTTCTTGTTT
TTGTTCTCCCTGGTGTTCTCCCTGGTTTGTATGTTCTTTTCATTCTCTCAGTTCGTTGTTTTGTTTTCTGTTCTTCACGT
TCGTCTTTGTTCTTTTTGTTCTCTCACTTCATCATCCGGTTTCCCTCCCTTGGTCTTCCCCTCGGTTCCTTCTCTCTCCC
CTGTTTGCGTCCTCTGATTTTCCTTTGTCCCTCTCTCTCTCTACTGGTTGCTTTCTTCCCCCCTGCTTTTCTGGTTTTTT
TCCCCAATTCGTACCCAGTTCTTTATGGGTTCTCCTCCTCTGTCCACCGTTTTTTCGTGTTTTCGGCCTCCCAGTTTTCG
CTTGTCTGTGTTCTTCCTTTTTCGGCCTCTGTTCGTGCCTCAAGATAATGGGGCACGTTCGCTCCTGTCTTTGAGAAGAG
TTAGGACTGTTGGCATCGATATCGTGGCCTCCGGAGAGGGCGTCGTGGAGGATAATGGGTAGCTGTACAATCCCTGCAAA
ACCGGTCCCTGGGATGAAGAAGAAGGCGATAAACAGTTTTATGACACGGCGCCGTTTTCTACTCTGCAGTGGCTCATTTC
CAAACTTTGATATTTTTTCGATTAAACCTCTGATTTTATTAATTAAATTAATTTTAAGTTCAATTAAATCCTTAAACATT
CAATTATATTGTCATGATCCAAATTTCAATTTATTCTTTATTTATTTCATTTTTTTTATTTTTACAAAATAAAATAAAAA
TAAAATAAAAAATTGAGTTACAACAATTTAAACTCCTAAATACTTAATTTTAAAACTCTAATACCATATTAAAAATTATT
TTAATTCAAAAACTTAAATTATTACTTGTGATTTTAATAATATTTTATATTACTCATTAACCCTCACAACACAAAACTAT
CAAGTAAATAGCTCCTAAAAAGTAATCAAATGGAAGATTAAACACATATTATCATCAATGTAAGAAGAAGAAGAAGAAGA
AGAAGAAGAAGCAAACTCTATGATCAACTCTTGAATCGATCTAGGGTGGTTCCTCTTCATAGAAACTGTAAAAATTACAA
GCGAGACGCTATCATTATCCTCGCTTCAATCCAAAATGAATGTAAAACTACAATTTTGATTAGTGATTGGGAGTGAGATT
TCCAATTAAACATGATAAATGACCAATTAAACTACAATTTTGATCCTAATCCTGCTCAATTCTGGCTTCTACTCTCAAAA
GTCTCAATGAGATATGCCACAGAGCAACTGAATTTCACTTCTGAGGATAGATAACCGACCAATGCCTTAATATATCATAA
TATTATATTTTCTAAAATGAATGATGAGTATGAATATTCACTTAACATCATTCACAAATGCTAGGTTATTTGTAGTTGGG
TACAAAAACCTCAAACATTTTAGATACATAATCAATTAGAGATCAAATTTAGTAAAGTGGGTTATATTATATACAAAATT
AATTTTCGTTTCCTTCGATTCCACCATGGCCAGCAAGTTCTTCTCCTCTTCATTTTTTTTTCATGGAAAATGTTCCTTTG
TAGCCGAATAATGAAAATCCAGTTGCTCTTTATGATGTATCGACCTATGTAGATTAATCTGGCAATTCTTTTTTTTAAAA
AAAAAATTCTGAAATATATAACTCAACTAGTCAGACTTTAAGTTTGCTCCATAGAGATCATCAGTTCGAGTTCTAAAAAT
CTCAGGGCTATTGAAGATTTACATGATCGTTAATTTCATGGCCCGTGAGATTAGTCGAGCTGTGAACAAATTAGCCTGGA
TACCCATGGAAAAAAAAAAAAGAAGAGGAAATTGAACCTTCCGTAGAATATTAACCATAAGAATCGATTTTGGCAAGCCT
TAACGATAAAGAAAGCACCAACCTTCCACGAGGTGAGCTCCAAAGTCAACAGTCCAGCGAATAGAACTTCTATTTAACAC
CACAGAAACCAAGTGGATTTGTCACTTCCCTTCTAGTTACGCAACTTATTTTTTCTCCTCTGCAACGAAAAAAACCGATG
GTGCAGTTTCAAAATGAAAGGGCGTGTTGTTTTAGGAAAG