| Basic information from miRBase |
| hairpin accession number: MI0002262 |
| Located between position 7526169 and 7526311 on chromosome scaffold_17 strand - |
| mature miRNAs for MI0002262: |
| ptc-miR169l (MIMAT0001968): TAGCCAAGGATGACTTGCCTG |
| References |
| [1]Dezulian T, Palatnik JF, Huson DH, Weigel D, http://genomebiology.com/2005/6/11/p13 (2005)., "Conservation and divergence of microRNA families in plants" |
| [2]Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, Putnam N, Ralph S, Rombauts S, Salamov A, Schein J, Sterck L, Aerts A, Bhalerao RR, Bhalerao RP, Blaudez D, Boerjan W, Brun A, Brunner A, Busov V, Campbell M, Carlson J, Chalot M, Chapm, Science. 313:1596-1604(2006)., "The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CTCGTTATTTAAGTTTTATGTGTTTCGTTCCCGAGTTTAACTCTGTTAGTTTTTGCGGGATTTAAATGTTAGGTTGATTG
GTGTTCATGGATCGAGTTTTGATTTCGCAAATGGCAGTTTATGCATCACAAATGCCAGGTCTCGTCCGGGTTTGTCCGGG
TCGCCCGGGTCATGGGTCGACCCGCCAGGTTGCCCGGGTCATGAGTCGACCCGCCGGGTCGACCGGGTCTTGTTAGTTTT
TTACATTTACCGGTCTTTCTCCTAACCCGGACCAGTCTACCCACCGGGTCGACCCGTCGGGTCGGTCCAGGTTTAATAAC
TATGCAACTAACCACTAGGAGTCGTATGAAATTCTTTCAAATTGGATTACCTCACAAAAATCTTATTTCAAAAATTTATT
ACTGAATATTTCTTCAAGTAGTCTATTAAAATACAAGTTAGATAACATTATTTATACTAGTCTTAAACATAAACTGAATA
AGAAAATAAAATTTCTAAACTGAATGATTGCTAAACTAAATAGCTAAAATAATAAAAAATCACTACAAAGAAAAAATATT
TTTGTAAACTAGATAGAAATAAAAAAGAAAAAACTAATAATTTTCCCTAAAAATTCTACTACACCAGTTCTTCAACCTAT
TTTTTATTTTGATTAGATCTTAAAGGTATCAATAGATTCTTAAATAAATCCATATATTAGTTTCAACAAGCAAAATTTTT
AAATAGTCATGTTAAACTCATTTGATATATATATATATATCCATGAATTTATTAAAATTTTCTAGCTCTATGAGTTTATA
GAAACATGAGGGCTTTATATTTTTTTTATATAAACAATACGGTTTGCAGCACGAGCTTCACATTATTTAAAGCAAAAAAA
AATATTAAGAAATTTAATGGTTTTTTAAGATAAAAAAAATCATATGATTTTCACATGACTGCTTAGTAATTTTTATTATA
GGAAATTAAAAATACTAAAATAAAAAAGCATGAGGATCTAATCAGATAAAAAAAAAAAAAAAAAGAAGTTAGGATCCTAA
TCAAAATTGTTCCCGGAGGTTGGGGATGGTTATGAAATGATTGTTTGGGAGTTTGGTTGCGGTTGCTTTTTAAAATATTT
TTTTGTGCCGAAATGTATTAAAATAATATTTTTTTTATTTTTTAAAAATTATTTTTGAGATCAGCGCATCAAAACAATCT
AAAATATATATAAAAAAATTAATTTTTAGTAAAAAAAAATTAAATTTTTGTGAAACGCGGTAAACGATGCCAAAGTTTGT
TCTAAAATATTTAAATTTTCTCTTTAGTTTTCTTAAAATTTTTGACAATAATTATTCTTTTGGCTTCCCAAGAAATAATA
CATTCTCTCTCCAAACTTATATAATATGATTCATTTTGAAGTTTCTCCCCTACATGAGTGATGGATTAATAGATTTGTTT
TACATATATATGTGGTATAACTAAGCCCGTGAATTCTTCCAGAAAAGGTGCGTTCTTGCTATAATACACAGCACTGATAT
CTACGACGATCCTTTCTTTGATTTTACTTGTTTTCCCCAGCATCTTTAGATGCTTTCTTGTACAAACTCTTTCACGATCG
ATGCATATTGTTCGTGATTCGAAAAGTTCAGCATTTCTCATGAAATAATGATCAGTTTTATTCTTCTGGCTATGGAGAGC
CTACTTTATACAAGGCCGGAAAGAGTAATTCAATGCATGAGGGCTAATTAAGGCGTGCCTCCTCCTCAATCCCAAAGTCA
ATCGGAACAATATTAGAACCTTTATTTGGTGGCAACGCCATTGACCTGAAATTTTGGGTGGGGGCATCTGTCGATCACAA
GTGGACTGGTATTGCCTGGGGAATCATGTGCTTTCAGAATTAAAGCATGGAAAAAGGCCACGAGTGAAGAAGCCATGCAA
TACCCCCTCGATTTTTAGTCAGAATTCAGGTTATCTTCTTCCCTTTTCTCTTTTTTTTTTTTTCAAGATTTTGTGAAGCT
TTCCCTTTCGTGAGGTCAAGATCATGATGATTTAAAGGTTTGTGATAGGGCCAGCGAAATTACTAGAAAAGTAGAATAAA
TCAGGTCAGAGACCCATACGTACGTGAATTAAGATGAGAACGAAGAGACAGGTAACACTAGCATGGCATGATCCAATATA
TATATATATATTAGTGGAATATTTTAGCTTCAATAATGCGTATGGTTTTTGTTTTTCTTCCCTTTTATTTTTTATTTTGT
GGGGCACTGGTCGTGCCATTGTTGCCCTTGTGCACATCATTATCAACGGACGTATCCTTTGAAACACACCTAAAGATCAG
ATCGATGCAAGTTGCCTCTTGCCTGGCCAGAGTGTCAGATGACTAATATGAGGACTGCCCGATTTATCAAAACCTTCGAG
GGCTTTCTTTCCTTTCGGAAATCCCATCTCCACCATTAATGGGCTGTATTGATGACATGTAGCAATAAGGAGAATATATT
CCATTATGGGCTAGTTAAATTATGCACTTGATAGGTGGATGAAAAATATAGAAATTGAACTTGTAATGGATGAGCCAGAA
ATGATTTTTCTTTCATTGTACGAATCTGGTCTTGATTCTTTTCAATGGGCTATAAATGGCAGCTCAAAACACTTGGTTTG
AGCACACCAGTAGTGGAGTAGCTAGAGGTGCATACATGGCATACATTAGAGGAAGAGAGGCCTAGCATGAAGGCTAAGAG
TCTTGTTTGGTAGCCAAGGATGACTTGCCTGCTCCCTTCAAGGAGGTTTCATGAAATGCAGACATGATCTCTCGAAACCC
CTGTTGGGTTTCAGGCGGTCTCCTTGGCTAACTTGACAGGCTCTTTCCTGTCATGCTTAGCCCTTCTCTTCTTCACCTAC
AGCTACGTACAAACCCCTGATCATTCTACTTGGCGTCGCATATATCAACTATATATTGTATGGTGCATTGGGCCGGCAAT
CAAATTTGAGGGGAACAGAGGCCTTACATGAAGATAAGAG