Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002271 |
Located between position 12074209 and 12074330 on chromosome scaffold_15 strand + |
mature miRNAs for MI0002271: |
ptc-miR169u (MIMAT0001977): TAGCCAAGGACGACTTGCCTA |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TATTTAACAAGATCTTATAATTTGAGCAAATTAATCATGTAATTCAGTCCATTTTATTTTTATTGTTTTCATTGAATAAA
CCAAGCTAATTTATATTAGTTTTTTTTTTTTAATTCAGCTCAGGCTAGACACATGTATAACTTTGTTTCTGGAAATTTTG
CATGGTAAAGAATATATATATATATATATATGTATCATCATCATCATCATCATCATCATGATGTGATGCTTAACGGGCAT
GGGTGCTGCGCAAGTAAAGGTAAAATAATAACGCAAAAGCTAATTCATCAGCAGGCAACGTACTTCGGTCTAATACTCTA
ATGTATTTAAGTGAAATGGTGGGTGGAAAGCTATTTAATTAATGCAGTCTATTAATTATTATGTATTAAAATGGTAAATA
ACTCCGGTCTAATGTTATTAAGTGAAACCTACTTCAAGGAAATAATTGTTTAGCCTGTTTCAAGAGGTTGACTTTATTGT
TCGGTGGTAGTTTTCATCGATAAATTATGCCTGTCATTTGGGATGATTTGTCTTCCCATCTAGAATTCACGATATTCGGC
TCGGGAGTGGTTCGATATCATTATCATATCAAACCCCCAGCTTTCTATTGCTGATCTTGTGCATTTATCTAACACGGTGT
ATGTGTTATTTTTGTGTTTAAAATTCTGTTCGGTATATTTTAATTTTAAAATATATTAAATTAATATTTATTTTAATATT
TTATGATAATTTTGATTGTTTGATATAAAAAATAAAAAGAATTTAAGAGATTATTTTAATATATTTTAAGTAAAAGATAT
TTTTAAAAATATTATGCACTATAATACTAAATACACGCTAAATGATTGTATAAACTTGTAACATGTTAAATGATTCACAA
AAAGGAAAAAAAAAATTGAAGGGAGAAAAGTATCTTGCTAGATATGGAATTCTCTCTCTGTTTTTTTTTTTTTTTTATTT
CTTCAAAAAAATAATTTTATTTACTGAATAAGTATAATACTGAATTTTATCATAGTTTTTTACCTTGATTGTGAGTTTTT
AATTTGGCAGTAATATCTGAACAAAATATATCATTAAATGATAGTATTAGAGTATTGAATTCTAGAGACCTATGAATTGA
ATTCAACAGTATTTTCTCGAGAAATTATGTCATTCTCTAGGCATTTAATGTGTGATTATCCAATTGGATGCCTTTCTAAT
TCTGATTTTTTTCATCTCTATCATAGAAACTTGTTCCTGCTATTAAATGTCGTCGCACCCTTGCTTACTCATGGCAGCAG
GTCTACCAATTGAGTTTTTTCTTTTTTTTTTCTTTTTCAAAGCAGCAAGTAGAATAAAAAACACGAAGGGACTATATTTA
AAAACAAATTGGCAGTCAATTTTAGAAGGAACTTTAAATTTTGGTTTTTTAAAATAAATTAAATTCTATTTTATAAATTT
TAAATTCAAATTGAAGAGATGAGTTTAAAATATTTTTTAAAATAAATTTTGAAATTTTGAACTAGGTTATTTATTTATTT
ATTTTACTGTGCTACTTTGAAAAAAAAAACATCGTGGGCTAAGCCTCGGCTGAACCACAGGAAGGTGTGGGGTGGGCCTT
TAAAAGGTTTCATGGCATGTGAAGTGCCCCTTCTTCCTGATTGGGTTTGCCATCCCCGTACGAAGGCTTCTATTTTAAAT
TATTCAGAGAAGCACTTTCTGGTCCGGTTGTACAACTCGAACCTCAGGCAGATCCCCCACTGCCCTAGATTCCATGCCAG
CTCAAAATTGCTAGTTTTGTGCTGGTATTCTTGGCTTTCTAGCAATGACAGGTGCTTTCCACAATCGCTGTTCGAACCAC
CAATTGCAGGAGATGAATCGATTTCACTTGGCAGAGCACATTTTTACAGATGTTTTGGCATTACAGAACAGAACACAAAA
GGCCACAAGGAAAAAAACACAAAACAAAAGGTTCCCTAAAACGGGTAAATTACCTTAGAACTTTTTGGAAACTCTTTGAT
TGTATTCAGAAATTCTAAATTATAGAAGCACAAGTGCAATATTTTTTTTTATATCAAGATTATTGTTGAAAGTTACAATG
ACAAATAAGAGCAATTTTTTTTTATTACAATAATTTTGTTAGTCATTTAATCAAAACATTCCAACTAACAAAAATAAATA
AATAAATATCGTTGTGCTGTGATTTTCAGCGAGTCCAACCACACCATCAATAAGTATCCTGAGGATATTGCTTTCGAACC
GAAGAAGATGGAATAATGCATAAATTTGCAATTCCAAAGTGTTTGAAAATCCTTCCACCCAAGTCGAATATAGAAAAAAG
ATATATAAAAAACGATTGGTAATAGAAAGCGTTGACATTTTTCTTGGGCGAGCTTAGAAATGTTTAACTCAGGGAATAAT
GATTAATTGACTTCGAAACTACCTGCAATTTGTACAAGCAATTTGAACTGTTATACATGTGTGTGTCCTATATATATATG
ATTCTCGGAGAAATAAGGTTCGGAATGAGAATCAAATTGTTTCACCATTTGGAAATAACCAAGGGTCAATGAACTGATTC
AATGCAAGTTGATTGATCAACATGCTATGTGGACACAACAAGGCAAAGCCAACCTTCGTACTTTTGCTCCTCGGAAGTCA
ATTTTCTTCCCTTATGAAGATAGCTACGAAAGCAACACCTAGGTAGCATAATGAACGTTAATGGATAATTGTTTGGTCCT
TTTCATAGCTAGAATATATTCGAATCCATCTCCTTTAGTAACATTTGATATCAATGTTATGCTCAACGAGACAACAAAAT
AGTAAAAAGGCTTTGTATATTGAGGGAAAAAGTGGTGGGGAATGAAGCTCAACTGTTTGCTTGGCAATTCGAATATGGCC
ATCTCACTCCTCATCGGCTATATAAATACAGACTTTCTCGTGGATTATTGTATCATCCCATCTTCTTGATTACTAGTATC
CATGAGAGGAAGAGAGGCCTTGTATGGAGATGAAGAGCTA