miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse



Basic information from miRBase
hairpin accession number: MI0002275
Located between position 6551729 and 6551851 on chromosome scaffold_5 strand +
mature miRNAs for MI0002275:
         ptc-miR169y (MIMAT0001981): TAGCCATGGATGAATTGCCTG

References
[1]Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, Bohlmann J, Grigoriev I, Hellsten U, Putnam N, Ralph S, Rombauts S, Salamov A, Schein J, Sterck L, Aerts A, Bhalerao RR, Bhalerao RP, Blaudez D, Boerjan W, Brun A, Brunner A, Busov V, Campbell M, Carlson J, Chalot M, Chapm, Science. 313:1596-1604(2006)., "The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray)"




>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CCACTCCGCTTCACTAGAGGGTCAATATTCCACCAACTTGAGATGTTCTCACCTTTAAAGTAGATTAAAGTCAACGCGTT
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