Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0007034 |
Located between position 2201526 and 2201626 on chromosome scaffold_12 strand - |
mature miRNAs for MI0007034: |
ptc-miR171n (MIMAT0005996): CGAGCCGAATCAATATCACT |
References |
[1]Lu S, Sun YH, Chiang VL, Plant J. 55:131-151(2008)., "Stress-responsive microRNAs in Populus" |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
TTGATATTTTCTAGGCAGTTAGCAGCCACACATTATAATAGTCTTTGATTGTAGATGATATTTCAAGGATCTGCCTCTCG
TACATGCAACGCCAAGATTTTCAAAGTCTGGACTCCTGAAAAGTTCATCATTTCCAGAAAAAACAAGCCAATGGTTTCTC
TTGGTCAAGCATCTCATGAATTATGGAGAGGGGTGGGGTTAAAAGACTTGGTGTCTGCGGCCTGAAACCCATTTGAAAAG
GACAATCTTGGTCGTGGCAGGAATCTCTCCTCTTCTGAAATTGGGATTAAATTCCACCATTGACGACAAATCAAGCTAAG
CACTCACCCTTTAATTTATTTTCTCCAATTTTCAAATATTATAGCAAAAGGTAACATCTGGCTGCTAGCTCAACTTTTGT
TTTATCTCTTATATTTAATACTATGTTTCGTTCTCCAAGTGCAAGCGTGATTTGTGATCTACACACACATGTATATACTG
AGTAAGTTTTTGTTTTTAAAAATTATTTTTTAATAATTTTAATGTATTAATGTTAAAATAAAAATATATATTAAATTTTT
TATGGGTATAAGCTAACTGGCATGCATTAAATTAATATGCTGTACCAATTGAATTAGATTCTGATCTGTCTTGGTGTACT
AAATATGTCGTTCTGTCCAGCATATATTCTATATTAATCATAAAAAGTACTGTTGTAAGATATAAGTATATATTATTTAA
TAAAAAAAGAGTACTATGTAACCAACAACACAGACCAAGATTATACAAATGACAGAGCTAAACGTGATTGAAATAGCTAC
TAGGGATTTGTTTACTGGTTTTAGGGTTCGATATGATGGTCTAATGAGATCCCCCAATTTCTTATTGAATCCTAAAATAA
AATCAAAGGGGAAAAAAAGCAAAATAGGAAGAAAGCTACGTGAATGCCTTGACTATGAAGTATGAACCTCCCATGATCTA
TTTTCATTCTTAAATTTGGCTAATTAAGATCCTGTTTGTTTTTGTGTTTTCAAAATGCTTTTAAAAAAAATTATTATTTT
TATTTTTGTGTTTTTCAGATTGTTTTGTTGTGCTGATGTCAAAAATAAAAAAATATATTATTTTGATGTATTTCCGAGCA
AAAAACACTTTAAAAAACAATCACTATTATACTCTCAAATACCCAAGATATTTGTGAAAAAAGAATGAAAAATTGAACTT
CCATTATAAGGAAAAAAAAAGATTCTATGATACTTTTAGATTTGGTGGCTTAGATTCTCCCTACATTTTCAAATTAGTTA
GATTTGGTGGCTTAGATATTGTGTTTCAATGAGAATTTTAATTGCATAGTACGAGGCGTGCTATTAATTTTTTTCCGAAA
AAATATTATGCTTCGACTAATATATGAATTGACTGAAGACATCTTGAAGGGGCCGAATTAAGTTATTGATACATATTAAT
AATATACATGTCTATTGCGTACGTATACTAATCAATAACTTTGAAATAAGAAAACTATGTAAACAAAATATTGATACAAT
TAATGTTACTAAAATTATAGTTTTCTAATGACTAATAAAAATCTTATTGGACCATGAAGTGGAGGTGTAAGGTTTATTTC
CTTAACTATTTATTAAAAACTTATGTTTTCTAATTTGACAGACATTATTGTTTATATATATAAAAAAAACACAGGTGTTT
ACGTAGTACAAGGAATGTTATGATAACCTTTAAATTCATGACCAGAGTTATGATATCAAGATAACCTCATAGAAAAAAAA
ATAAAAATAATTTAATTTACTTTGGATTAACCTGTCAAATTAATCTGTGACTCTGATCATGAAACTGAAATAACCTCGTA
GAGAGCAAATAAAAATAAATTATGAATCTTAACTCTTAATTGACCTTACAGATCCAATGTTGAACAATACAATTTGTAAA
AATTTTAATTAAAAAAATAACACAAAAAATAAGTCAAGTCAATCTAGGTTAACTCGTTAAACACTATATCTGGATCACAA
TGTCGAGATAACCTAATAAAACATGAACTGAAATAAATCATGAAACCCAATTTTCATTGAAACACAATATTAAATAGTGA
AATTGAGAAAAAAATTAAAAAAATTAAGTCAACTAGGTTAATCTGCTAAACTCATGACCTGAGTCATGAAACGAGGACAA
TCCAATAAGTCATGAGACTAAGATAATCTATTAGAAAGAAAAAAAAACAACTCAATTTAACCGGGGTTAAAATGCCAAAT
TCTGTAACCCTAATTATGAGATCAAGATATCGATATAAAAAAAAATCAAAACAGATTATGAAACTCAATTTCCAACCAAT
TCAATATTGAATGATGAAAAAAAAAATTATACAATCCAAGTCAACTTAGATTAACTCATTAAATATTATTCTCGAATTAC
AAAACCAGAATAATATTATAGGTTATCTCGTTGTTACAAGAATATGTTAACAAATCTAATATTAAATTAAAAAAAAAAAA
CAGACTTATTCGCAAACACATTCGAACATGTATATGTACTGGAATTACAGGTGACTGTGGAGCTAGCTAGCTGGCCTGGA
ATTATTATAGGTTTGATTCAACAATAAATTAACCATGACATGTGCATATTTACGACACAAATGCGACATGACTCGCTCTT
CCTTCTTGTTCACATGCCAAGATTAAAAGAAATCATCCATTATGGAAGTCCTTTTCCTAAACAACATGAGAGAGAGAGAG
AGGTTGAAAGTGGGATTCCCAAATCTTGATCTTGATAACATCGTTCCAATATGCTTATAGTAAATTATATATATCGTCCT
AATTTACCTTATCCCTTAAATCTATGAATCTAGGGGCCGGGCCATCCACGATATGGAGACCGAAAAACCCTTAAAAATTG
TAGCTCCTAGCTAGCTCCTCCTCCTCTTCTATATATATGGAGGTTCCACCTCCTCTATCTAAGCATTGAGGTGAAGTAGT
GTCCATGGAAGAGAGATCAAGAAATGGGCATGTTTTTGGA