Basic information from miRBase |
hairpin accession number: MI0002215 |
Located between position 9081111 and 9081209 on chromosome scaffold_14 strand + |
mature miRNAs for MI0002215: |
ptc-miR164d (MIMAT0001921): TGGAGAAGCAGGGCACGTGCA |
>promoter (3kb upstream pre-miRNA, by PMRD):
CTTTTTCCCGAGGCAGAGTCAGACGGATGCATCAAGTGCAGTGGAATTTAGCTTGTTGGGAGTATGATAAGTTTCAAGAG
CATCTGGAGATATATGAGTGTATGACCAAATAAAGCATTCACTACAACACAGCACAGCAGTCTGCAAGAGCAGGGCGCCA
CACGCTAGCATTTATGTCTATAGATTTGATGATGACCTCATGCCAGAATCTATGTTCTTCCTCCACAAGACAGGAATGGT
GATTTCAGAGTGACACCAAATCCTACCATTTAAAAAATGACCTTCTATTTATCTATAGTTTTAGCGGTAAAAGCTTGAAA
ATAAAAAAAAATATTTTTATTATAGTTTTAAATTCGAGCTACATGGATACTAATATAATAGTCATTAGAGGCTTATATAA
TTGTTAATTTCAGGATCAATGAGATTAGTTAAGATACACGCAAGCTGACCCAATCACCCACGTTAATAATAATAATTAAA
AAAAAAAACCTTCTCAGATCGCTCACTGTATATATGGACCTTACATAGCTAGCTAGCTAGCTAGCTGGTGTTCCATGTGA
TGGACGGCAACTTTACTTAAACATCACTGCTTGTCTGGCATTAGCTCTTTATTGGGTATTAAATATCATTACTAGGCAAG
CAAATTTTGGATTTCAATTTGAAATCATTTGCCTGCCGATGGACATTTTTAGGTGCTCAGCTTCAAGCTAATATTTAGTT
AGTGTTTAGGCAGAAAAGATAAAGAAAATTAAAAAAAAAAAGTATTTGGTTGTGAAGATGGGAAAAAAATGAGTTTTGTC
TCCGATTCATAGATAATTTTTAGCCATTTTCCCGTCCCTCTATACAGGAGGGAAACATGGGATAGGGATGGAGACAATAC
TAAGTTTTTTCTTTCACAGATGTCCCCTTTCAACGTTTCGTGATTTTAAATTTTTAACCTTATTTAATTTTGAAATATGT
TTTATCACACATATATTAATTTTCAAAAATACTTTTTTAAAATATAACTCCATTAAAAGTTTGATTTTTTGATTTTATCG
AGTTAATATTGAAAAATAAATTGCTCAAAATAAAAATAAATTATTTTATGTAATTTAATAATCTATAAAAAATAAAAAAT
GGATGAATTTGAGTAAATATTATGCATGACTTTAATAAAACCAATCAACCAAATAGTGATTTTTATTTAAATAAAAAGTA
TAAGAAGATTATGAAACAAGTATAAGAAGATAGTTTTTTTTTTTTAATCAAAATGAGTTAGTTTTTTAAGATTATGAAAG
AAAATAAATACCATTATTGAAATATTATCATAATAATTAAAAATACACAGACATTTATATTGTTTATCTTGGTTTAACTC
TCATGAATTAATATAATATATGGACATTTATTATGTCTCGTATATAATATTAAACCCGATTTTATCTTCATTTTGTGTTT
TATTTCTTGATTATCTTTATCTATTTTATCCGAGATAATAATAAAATACTATTTTAATTATATATTCAACCCAACAATTA
TTTTTTTAATAGTCAATACTAGGACATTAGTCTTGTTTTGCCAAAAAATAAAAAATCGGAGGTAATGTGAAAGTCTTGAA
AAATTCACATGCTATGTTGATCTCTCTTGCATAAAAACTAACACTGCCAACGCAGCATTATAATTTCAGCATGATCTAAA
TTCAAAGCTGGAGAATGGGCAGTAAAGATTCATTTCTCATTTCAACTCAACATCATCAAGAACACACGCATGCTCCTCTA
CTATTAGCTAGGTTCCTACAAAGGAAGGGCATGGCCCTGTAACCATACCCTGCGCTGCCTGCCTGCCTGTCTCGACTCAA
TTAACACCGAGATCAGCATCGGAGGCTAAGAATATTGTAAACCGGCTTCAAGGCTGAATCCGTAAAATTAAGCCCACCAT
AAATTCCTGCGGGGGGGAAGCTGGTGCCTACTTGTAGGGAATCATATCTACCTAGGGAGCCTCGCAGCTCGGTCTCAAAA
ACTCGTGTACTCAAAGACATTTATACCAACACGCAAACCCTACGTGCACTCTTACATTATTCTTCTGATACTGCTCGCAT
TTCACCAACAAGGTTCTTCCCCTCCCAAAAGAAAAGAAATTAGAACTTTGACCCCACCAAAAACACCGTGCTTCCCAAAT
CATCGCCCGAGATTCTTGATCCAAAAAGGCTTCTAAAATATATATATATATACTTTGTATATCCAAACCAGCTTCCTTGT
TGAATAATTTTTTGAGAATTTAAAATTAATAATTAATTAAACTTCTAATGATTCTGAAATCATGAGATTTGTGATACTCG
AACTGATGATTTTTGAGAAATAAATTTAAAATCTGACCAATTAGCTATTTTTTTAAAATTAATTCATTATTTTTCTTGTT
TTATATAGTGCTTGGACTCATCATGTACAATATTAATAAATATTTTTTAAAATAATATTTTTATTGTTTAAAATTTATTT
TTAATATTAATATATATAAAAATAAAACACGCCAACACATTTTCAAACAAAGTTACAGCTCTAGTCAGATAAATCACTAG
TGCATTGGATCGTGCAAAGAACAAAGTGTTGGTGTTGGTGGCTTTTGTGAAATTAAGGCATGGTATGACTCTTCTAGTCT
TCTTTGTCTTTGCTTAGACATCTCCTCATCCAGCACTCTACTTTGAATTTCTTCTCGACCCACCATGATTGCATGGCATG
CTCTTAATGCTTGCCAAAGATTTTCTCCTTTTTTTTTTCTCTTACACCATCAACAACACTTTGAAATTTACCCAGTACGT
AGTACTGCTCCTCTTCTATGCATTAATTGAAGCAATGTGCAACCTCTTCCTGTACTTGTCTCTCCCTCCTCTTCGCGACA
TTCGCACCTATAAATACATGAGCTCCTTACAGCCATTTCAAAACATCAAACTAGCTTAACATTTTATATCATTCATCGAG
CTGGCTAGTCAACCAAGGGAATGGAATTCTGATGGGTGGG