ABOUT THIS RECORDspecies: Linum usitatissimum
miRNA family: MIR838
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Linum usitatissimum Linum Linaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTTCTTCTTCTTCTTGCTGC miRNA* GGCTAGGAACAAGGACGAAAAA mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
TCCTTTTTTCTCTTTTTCCTCTTTTCTTCTTCTTCTTGCTGCCCCTCCGGCAACTACAGTGGCGTCGTCGTTGCTCCTCCCCATTCTTTTCTCTTCTTTT
ACTTTCTTTGATTCTTCTTTTTTTTCTCTTTTCCCTCTCCTCATCTCCTCTCTATTCCCTCGCTTCTCACAGCGACGGCTACGGCGCCGTCCCCGCCTTC
ACTCTCTACTTCTTTCCTCACAGCGACAGCGGCGGAAAGCCGTCGCCTCCCTCACCGGCAACGAAAAAGAGGAAAAGAGGGAAGGGGAGACGGTGACCCC
ACCGCCGACGACGCGGCCATCGGCCGGAGAGGAGACAGACGGCGAGAGGAAGAGCAAGGGTAATGAAATTAGCCGCTGACTTGCTCGGGAAATTAAGGCT
AGGAACAAGGACGAAAAAACGGAGCTCGACGAAGGT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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