ABOUT THIS RECORDspecies: Nicotiana tabacum
miRNA family: MIRf536
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Nicotiana tabacum Nicotiana Nicotianeae Nicotianoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATCGAAGGGAGCTCTAA miRNA* GGAGCTCCTTGAAGTCCAACA mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
TAGGGTTTTGAGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAACAGAGGATCTAACAGGTAAGATTAAGCTGCTGACCTATGGATTCCTCAGTCCTATCTATTATTTGA
TAGGATAGGTAAGTGGGTAGCATATGTCAGGAGCTACATTACCCTAAGTTGGATCGCTTATTGGATCGAAGGGAGCTCTAAATTCATTAGAAC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sly-MIR159: 5e-23 PMRD sly-miR159: 5e-23 microPC miR159: 2e-90 | UniProt no hits RFAM MIR159: 1e-30 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR159 from microPC (MNEST045391) |
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