ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIRf341
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CAAGACTTTCTAGCATTGCTC miRNA* ACAATACTAAAAAGACTTGCA mismatches: 4 bulges: 0 |
pre-miRNA
GTTAAACATATACTCCCTCCGTTTCATAATACAAGACTTTCTAGCATTGCTCATATTTATATATATGTTAATAAATCTAGACACATATTTGTATAGATTT
ACTAACATCTATATGAATATGGACAATACTAAAAAGACTTGCATTATAAAACGGAGGAAGTATATGTTTAC
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non-miRNEST targets: none
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR819k: 1e-23 PMRD osa-miR819k: 1e-23 microPC miR1130: 4e-20 | UniProt no hits RFAM MIR1122: 1e-42 | most similar mature miRNAs |
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