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Species belonging to selected taxon:
Cynodon dactylon
,
Eragrostis curvula
,
Panicum virgatum
,
Saccharum hybrid cultivar CoS 767
,
Saccharum hybrid cultivar SP70-1143
,
Saccharum officinarum
,
Sorghum propinquum
,
Cenchrus ciliaris
,
Zea mays
,
Sorghum bicolor
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST001712
species:
Panicum virgatum
miRNA family:
MIRf10
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Panicum virgatum
Panicum
Paniceae
Panicoideae
PACCAD clade
Poaceae
Poales
commelinids
Liliopsida
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
GCTCAAAAGATACGTCTCGTC
miRNA*
TGGAATGTATTATTTTTAGCAT
mismatches:
4
bulges:
1
View larger
pre-miRNA
GACCTAACTAG
GCTCAAAAGATACGTCTCGTC
GTGTACATCAAAACTATGCAATTAGTTTTTTTATTTACTTACATTTAATGCTCCATGCATGAGGCAAA
AGATTTGATGTGATAGATAAATAGTAAAGTTTGGAGAGAGAAATTTTGGAACTAAACATAGCCGAAGTAGGAGACATCTATTTTGATGGTACAATCTGCT
GGTTACTCTTATAATATCATCTGTTGTCTGTTACACCACATTTGTCACTATTATGTCCACCTGTAATTTTAACTTTTGTGGTTCTCAGAAAATTGCTCTC
ATTAATTAGTTTGAATATAAAAAATAAAGTTGGGTATTCTGGAACTGACAAGGTACTTAGCTTCTTTCTTTTTAAATCGAGCATGATTCTTCTGTTCTTT
TGATCTTTATTATAGACCAGTGTTTCAGAGCCAAAGGGCAGCAGAACAGACTAATATAGTTCACAAGGAACCATGTATTATGGAGTAACAAACGTTGCGA
GTCACTTTGGAGGTGGCTCTGTAGGTATGCTATTTGGTTCTGTAGCTCTCCTACTCCGCTGTAGCACC
TGGAATGTATTATTTTTAGCAT
TAAATTGT
dot-bracket secondary structure
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HuntMi prediction:
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