ABOUT THIS RECORDspecies: Phaseolus acutifolius
miRNA family: MIR159
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CTTCCATATCTGGGGAGCTTC miRNA* AGCTGCTTAGCTATGGATCCC mismatches: 5 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGGAGTGGAGCTCCTTGAAGTCCAATTGAGGATCTTACTGGGTGGATTGAGCTGCTTAGCTATGGATCCCACAGTTCTACCCATCTGCATGTTTTGTGGT
AGTCTTGTGGCTTCCATATCTGGGGAGCTTCATCTGCCTCTATAGTATCATCCTTCTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pvu-MIR159a: 7e-93 PMRD pvu-miR159: 7e-93 microPC miR159: 1e-66 | UniProt no hits RFAM MIR159: 2e-22 | most similar mature miRNAs |
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