miRNEST 2.0: an integrative microRNA resource miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse

Species belonging to selected taxon:

Phaseolus acutifolius, Phaseolus coccineus, Phaseolus vulgaris



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST001915
species: Phaseolus acutifolius
miRNA family: MIRf264
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCGAACCCGAACCTGAACCCA

miRNA*
GGTTCAGGTTCGGGTTCGGGT

mismatches: 0
bulges: 0

View larger
pre-miRNA
GGAAGCGCGACGCCGAGTTCCGTCTCGAGCGTCTCCGCACCGCTCGAGGTTTAGAACCGAAGCTTCCCCCTACCGAACCCGAACCCGAACCTGAACCCAA
ACTCGAGCCCGAGCCTTCTTCCGACGCTGGCCACATCAACCCCATCTCAGACTCTAAACTACAATAAACTTCAGATATTGTATGGTAATGATGGGGAAAC
TCTTGAAGCAAAACAGAAAAAGAAAACCCAGAATATTATGTTCATCTGGAGACCCTCCTCCTACTGCCAAAAACATCTCTGTGACTCTGCATCTTCTCGT
GTCTCAAAGCCCTCTCCCGGTCCTTCTCTCTTCTTTCCCTYTTCATTCTCTCTTCCCTCAATTCCTCCATCGTCTTCCTCTTCTTCTCACCCTTATTCTC
TCTCCTATCGCCGTCACCACTTTCATCCTTCACAACATCATCATCATTAGGTTTCCGAAGATACCACGGCAACTTAACCCCCTTTCCTGCAAGCCCGTAA
CCAAGCCTATACTTCTCATCCTCCGGGCCCACAACAACGGCGGGCTTGGGCCCTCCCTCCTCCCTTTTCTTCTTCTTGGCAGGGGGACCCTCTTTCTGAG
GCCCCTGAATTGGGTCAAAAATCTTGATCCCTTCGAAGAGGTTGATGTGGCCAGCGTCGGAAGAAGGCTCGGGCTCGAGTTTGGGTTCAGGTTCGGGTTC
GGGT
TCGGTAGGGGGAAGCTTCGGTTCTAAACCTCGAGCGGTGCGGAGACGCTCGAGACGGAACTCGGCGTCGCGCTTC


dot-bracket secondary structure
.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((......(((((((.........))))))).)))...)))))))...(
((((...((.....((((.(((((((...((((....((((((((..(((((.......................)))))))))....)))).)))).((
(....((((........((((...............................................................................
.........))))......)))).......)))..((.........(((((((.(((.........))).)))))))..........)).((((((((..
....((((................))))...........))))))))(((...........)))))))))).))))..)).(((((..((((.....)))
))))))(((..(((((((.....))))))).))).))))).)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
))))
)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))



SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits
UniProt no hits

RFAM no hits
most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record





Liczniki na strone;