miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse
Home
Browse miRNAs
Deep-seq predictions
Mirtrons
miRNA genes
Degradomes
Download
Upload
Contact
Species belonging to selected taxon:
Phaseolus acutifolius
,
Phaseolus coccineus
,
Phaseolus vulgaris
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST001915
species:
Phaseolus acutifolius
miRNA family:
MIRf264
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus acutifolius
Phaseolus
Phaseoleae
Papilionoideae
Fabaceae
Fabales
fabids
rosids
core eudicotyledons
eudicotyledons
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCGAACCCGAACCTGAACCCA
miRNA*
GGTTCAGGTTCGGGTTCGGGT
mismatches:
0
bulges:
0
View larger
pre-miRNA
GGAAGCGCGACGCCGAGTTCCGTCTCGAGCGTCTCCGCACCGCTCGAGGTTTAGAACCGAAGCTTCCCCCTACCGAAC
CCGAACCCGAACCTGAACCCA
A
ACTCGAGCCCGAGCCTTCTTCCGACGCTGGCCACATCAACCCCATCTCAGACTCTAAACTACAATAAACTTCAGATATTGTATGGTAATGATGGGGAAAC
TCTTGAAGCAAAACAGAAAAAGAAAACCCAGAATATTATGTTCATCTGGAGACCCTCCTCCTACTGCCAAAAACATCTCTGTGACTCTGCATCTTCTCGT
GTCTCAAAGCCCTCTCCCGGTCCTTCTCTCTTCTTTCCCTYTTCATTCTCTCTTCCCTCAATTCCTCCATCGTCTTCCTCTTCTTCTCACCCTTATTCTC
TCTCCTATCGCCGTCACCACTTTCATCCTTCACAACATCATCATCATTAGGTTTCCGAAGATACCACGGCAACTTAACCCCCTTTCCTGCAAGCCCGTAA
CCAAGCCTATACTTCTCATCCTCCGGGCCCACAACAACGGCGGGCTTGGGCCCTCCCTCCTCCCTTTTCTTCTTCTTGGCAGGGGGACCCTCTTTCTGAG
GCCCCTGAATTGGGTCAAAAATCTTGATCCCTTCGAAGAGGTTGATGTGGCCAGCGTCGGAAGAAGGCTCGGGCTCGAGTTTG
GGTTCAGGTTCGGGTTC
GGGT
TCGGTAGGGGGAAGCTTCGGTTCTAAACCTCGAGCGGTGCGGAGACGCTCGAGACGGAACTCGGCGTCGCGCTTC
dot-bracket secondary structure
.(((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((
(((((((((((((((((((((
(
((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((((....(((......(((((((.........))))))).)))...)))))))...(
((((...((.....((((.(((((((...((((....((((((((..(((((.......................)))))))))....)))).)))).((
(....((((........((((...............................................................................
.........))))......)))).......)))..((.........(((((((.(((.........))).)))))))..........)).((((((((..
....((((................))))...........))))))))(((...........)))))))))).))))..)).(((((..((((.....)))
))))))(((..(((((((.....))))))).))).))))).))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
)))))))))))))))))
))))
)))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))))
SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
no hits
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
most similar mature miRNAs
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
Source sequences
download this record