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Species belonging to selected taxon:

Cryptomeria japonica, Picea abies, Picea engelmannii x Picea glauca, Picea glauca, Picea sitchensis, Pinus banksiana, Pinus contorta, Pinus pinaster, Pinus taeda, Pseudotsuga menziesii var. menziesii



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002067
species: Pinus taeda
miRNA family: MIR952
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Pinus taeda Pinus Pinus Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AACTGAGAATGCCATTGGTG

miRNA*
 CTAATAGCACGCTTAGTTCA

mismatches: 3
bulges: 0
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pre-miRNA
 TGAACTACTCGCGCATTGAACTGAGAATGCCATTGGTGGAGTAAGTACGTCAAGGGACGAAACAGAATTAATTTTGATTAACATTTTATTAACCTTCAACT
CTACCTTGGCTTATGGAAGTTCGTGAAGGTCACAGGGCAAGGACTAGTCTGCTGGTTGCTGCCACAGTCAATTGGGACTCTCCCAAGTTATTCTCAGCTG
CAGCATTCCGAAGTTATTCAATGTTGCAGCCGAGAATATTATGGGGACAGTCCATTGGTCACAACAGCCAGCCGATTACACCTTGTATGAGTGCCCCAAC
TGGTGTGAGTTTCATGAACTGCCAGAAGCCAAAACAGAGTTGCAACGCTAATAAAACATTATGCAAAATTAATTCCATTTTGTTGGTTGACATACTTCAT
CCGCTAATAGCACGCTTAGTTCAATTTGCTAATGGTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD pta-miR952b: 0

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

Identical with: pta-MIR952b from miRBase (MNEST039443), pta-miR952b from PMRD

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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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