ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum
miRNA family: MIR824
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Raphanus raphanistrum Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TAGACCATTTGTGAGAAGGGG miRNA* CCTTCTCATCGATGGTCTAGA mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGACAGGTTTGCTCGAGTTGTCTCTCATATCTAGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTCACCAATCTCTAAATGACTAAATATACAATTA
GTATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTTCTATACATAAAGTGCACTGATGACTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAGGTCATGCCGAG
TCTCCAACTCATATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCCCTAAGAGATGCCAAACTTCTGTCTGGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATA
ATTTGTAGCTTGCACAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGAGGTGCTGGATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGTC
TAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAAA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR824: 0.00000000000003 PMRD bra-miR824: 0.00000000000003 microPC no hits | UniProt no hits RFAM MIR824: 0.0000000000005 | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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