ABOUT THIS RECORDspecies: Raphanus raphanistrum subsp. landra
miRNA family: miR824
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Raphanus raphanistrum subsp. landra Raphanus raphanistrum Raphanus Brassicaceae Brassicales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA CCTTCTCATCGATGGTCTAGA miRNA* TAGACCATTTGTGAGAAGGGG mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGACAGGTTCGCTCGAGTTGTCTCTCATGTCTAGACCATTTGTGAGAAGGGGTTTTATAGGTGCACCTCACCAATCTCTAAATGACTAAATATACGATTAG
TATTAGGCTCATATAAGGAAGTTAACTTCTATACATAAAGTGCACTGATGACTTTTCCAGATGCTATATAGATACTTTTTAGAATTAGGTCATGCCAAGT
CTCCAACTCATATATAATCGTATACACTTTTGGACATACATTTTCTCTAAGAGATGCCAAACTTCTGTCTGGAGTGGAGCTTTCTCGTGATAGCTCATAA
TTTGTAGCTTGCACAACTTAAGCTACACTAGTTTACTTGATAAAAAAATTGAGTGGAGTGGGGGGGAGGTGCTGGATTATTTCCCCTTCTCATCGATGGT
CTAGATTTGCGAGGTGACTCTAATAGTGGTAA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase bra-MIR824: 1.0E-13 PMRD bra-miR824: 1.0E-13 microPC no hits | UniProt no hits RFAM 4MIR824: 2.0E-12 | most similar mature miRNAs |
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