ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum hybrid cultivar SP70-1143
miRNA family: MIR408
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum hybrid cultivar SP70-1143 Saccharum hybrid cultivar Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT miRNA* ACAGGGATGAGGCAGAGCATG mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
TATGGTTGGAGACAGGGATGAGGCAGAGCATGGGATGGGGCCATCAACAAAATTTCCAATTTCTGTCCTCCGCTAGGCCGCTACTGCATTTATGTTTGCT
TGCTCACAAAACGGAGGGATTTGTGAGAGTTATCAGGCAGAAAGAACAAAGAAGGTGCCTCCCTGGTGAAGTGGTGATGGCCTGACCTGAGAGGGCTGAG
AGCTCAGCTGGTGTCCTGGTGTTGTTGCTTCCTCCCCTGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCCCCACCG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase sof-MIR408b: 1e-150 PMRD sof-miR408b: 1e-150 microPC miR408: 0.0002 | UniProt no hits RFAM MIR408: 0.000000000000001 | most similar mature miRNAs |
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