ABOUT THIS RECORDspecies: Saccharum hybrid cultivar SP70-1143
miRNA family: miR827
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Saccharum hybrid cultivar SP70-1143 Saccharum hybrid cultivar Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGTTGGTGGTCATTTAACC miRNA* TTAGATGACCATCAGCAAAC mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
CTAATGCAGCTCCGAACCTGTTTTGTTGGTGGTCATTTAACCATGCTTCCATCGATGGGTGCATGGTTTATGGCAGAGTGTGATGCCATGAACTCATCAT
GGTCATGCATGTGTGCATGGTTAGATGACCATCAGCAAACATGTTCACGAGGCATGCA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase ssp-MIR827: 1e-69 PMRD osa-miR827b: 0.0000005 microPC miR827: 3e-64 | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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