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Species belonging to selected taxon:

Agrostis stolonifera, Allium cepa, Oryza sativa, Avena barbata, Avena sativa, Curcuma longa, Cynodon dactylon, Dioscorea alata, Elaeis guineensis, Eragrostis curvula, Festuca arundinacea, Festuca pratensis, Hordeum vulgare, Hordeum vulgare subsp. spontaneum, Leymus cinereus x Leymus triticoides, Lolium perenne, Musa ABB Group, Panicum virgatum, Pseudoroegneria spicata, Saccharum hybrid cultivar CoS 767, Saccharum hybrid cultivar SP70-1143, Saccharum officinarum, Sorghum propinquum, Triticum monococcum, Triticum turgidum subsp. durum, Zingiber officinale, Cenchrus ciliaris, Brachypodium distachyon, Zea mays, Triticum aestivum, Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002469
species: Saccharum officinarum
miRNA family: MIRf75
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Saccharum officinarum Saccharum officinarum complex Saccharum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GTCGAGACGAATCTTTTGAGC

miRNA*
 TCAAAACATTCGTCTCACAA

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 AAATTTTACAAGATTCCTCATCACATCGAATCTTTGGACGCATGCATGGAGTATTAAATGTAAGTAAACAAAATAACTAATTGCACAGTTTGTCTGTAAA
TGTCGAGACGAATCTTTTGAGCCTAGTTAGTCCATGATTGGATAAATTTTACCAAATAACAACGAAAAGTGCCACAGGGACTTTACACCAACTTTTACAC
CATCTAAACACTACCTAAATCATACTATCATGTGGGATAGCAGCTGGTTGAGCAACAAGTTCAATTATACATACGTGCGTTGTTGTTTAAGCTACCTAAT
AGTACTGTAGCCGCCCCTGTGAAATTAAGGCTGTGTTTAGATCTAAATTTTGAAGTGCCCAAATACACTGTAGCCATTCGGTTGTATTTGGTAATAATTG
TCCACCATTGACTAATTAGGCTCAAAACATTCGTCTCACAAAGTACAACCAAACTGTACCATTAGTTTTTGATTTTATTCACATTTAGTATTTCATGCAT
GTATTCGAAGGTTTGGTGTGACCGGAAAATCTTTTTTTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR2124h: 0.000000000002

PMRD osa-miRf11301-akr: 0.000000000008

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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