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Species belonging to selected taxon:

Solanum habrochaites, Solanum lycopersicum, Solanum melongena, Solanum pennellii, Solanum torvum, Capsicum annuum, Solanum tuberosum



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002678
species: Solanum torvum
miRNA family: MIRf34
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Solanum torvum Solanum Solaneae Solanoideae Solanaceae Solanales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TATGGAACGGAGGGAGTACAA

miRNA*
 ATACTCCCTCCGTTTCATATT

mismatches: 1
bulges: 0
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pre-miRNA
 AATCAAAGAATTATACTCCCTCCGTTTCATATTAAGTTAATTGTTAGGGAATTTTTGATGTTTCAAAATAAGTTAATTGTTAACTTTTCAAGGGATGTGT
TGGAATTTTTTCCCAATTTTACCCTTCATTAATTAAGTTTCTAAGGTTGAGTTTTGTATAAGAAATAAATAATGCATTAAATGAATGTGTGAAGTTTGAA
AAGGGTAAAAATGGAAAAACATGATTAAATTTTGTCTTTGTTTCTTTTTCTTAATATGTGTGAAATGACAACAATTAACTTAATATGGAACGGAGGGAGT
ACAAGAAAAACCA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM MIR1122: 0.00008		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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