ABOUT THIS RECORDspecies: Triphysaria pusilla
miRNA family: MIRf21
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Triphysaria pusilla Triphysaria Rhinantheae Orobanchaceae Lamiales lamiids asterids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGGAATCCTGATGATGCTGCT miRNA* CGGCTTTATCATATGCCCTG mismatches: 5 bulges: 1 |
pre-miRNA
CAATTTTGTTGTGGTGTTGTTAATGATATCTGCGGAGGTTGTGGGAATCCTGATGATGCTGCTGCAGCATTGGCTAACAATCGACGGTCATGATTCATTT
GTTGCCACTGTTGTTGTTCTCCATTTCTTGACACGTCATCTCCTCCTCCCGGAAATTGATGACTTTGATAATTATGTGAGTTAAATGGTAGCCTGTTAAA
CATTTGAAGCATGTGGGGTTCATTTGTTTGCTTGACTTGTCCAAACCTATGTTGCTGCTGCATTTCATCTCTTCTTTCAGGCTGCCGGAAATTCAACTCA
GGTCTTAATCCTTGGCGTCTCCAATCACCACTAAATTGTGTTGAGAAAGAATTTCTTTGTTGTGAAGCTGAGTTTCCCAAACTTAGGTCCAAATTGTGGT
CTGATGATGATGCATTGTTTGAAGACTCTGCGGCTTTTAGTTCATCATCATAAATGGATGGATCAAAATTGGTAACAGCTTCCTTGCCATTACATTTTAT
GGCGGCTTTATCATATGCCCTGGCAGCTTCAACTTCAGTATCAAACAAACCCAAATAAACA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|P47927|AP2_ARATH: 2e-16 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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