ABOUT THIS RECORDspecies: Volvox carteri
miRNA family: MIRf117
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Volvox carteri Volvox Volvocaceae Chlamydomonadales Chlorophyceae Chlorophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCTACCGCCGCCGCTGCCGGC miRNA* TGGTGGTGGTGGTGGTAAAGT mismatches: 1 bulges: 0 |
pre-miRNA
GGCAGCGGCTCTACCGCCGCCGCTGCCGGCGCCGCCGCCAGTGGCGGCGGTTGCTGTTGCGGCGGCTGCCGGGTCGTCCGCGGAAGGCTAGCGGCAATCC
GCCGGGACCCCGCTGCGGCCCACCCCCGCCGGGGGGGGAAGGGCAGCCTCAGCCTCAGCCTCCTGCAGTGGCCGATGGGCACTAATGAGGGGGATGAGGA
GGTGGGAATTCTGTGCAGCAGCAGCAGGTTAAGCTGAATGAGCAAGTGGGTCGCTACGTCCAAAGCACCAACTACCAACTGCCAACTGCCACGGGAGTCT
GGAGGAGCGGGAGACGACGGGTGTGGCGACGATGGGCAGCTGAGCGTTGCCGGCGCTAGCAGCAACAGCAACAACAGCAAGAGCAGCAAGAACAGCAGCA
AGAGCGGCACAAATGTGACGCCAGCAGCAGTAACAGCAGCAGTAAGAATCATAACAGCATGGACACAGCAATTGTAGTAAGGGTGGGAGTGCAGCTGTAC
GGCGGGTATTGTACGGGGTGACGTTATGGGTTGGGGAATGGGGAGAGATCGGGGGAGGGGGGGGGTTGCGCGAGGTATAGGGGCGTGTGAAGGGCCACAG
AGGCGGTGAGTCATATCTCCGATGACCCGGGCGCCAGCTGGTGGTGGTGGTGGTAAAGTGGTGGA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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