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Species belonging to selected taxon:

Zingiber officinale



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST002846
species: Zingiber officinale
miRNA family: MIRf756
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Zingiber officinale Zingiber Zingiberaceae Zingiberales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 AGATCATCTGGCAGTTTCAAT

miRNA*
 TGAAGCTGCCAGCATGATCTGG

mismatches: 1
bulges: 1
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pre-miRNA
 ATAAATTGTTGGAATGAAGAGGTTGAAGCTGCCAGCATGATCTGGTCATGTAGTTCCTTCTGCTTGCTTTTTCTTTGAAAGTTTTTCGCAAAAAAAAAAGA
AGTCATCTTTCGAGTGTTTAATCGCATCAATTCTTTTTTCACGTCGTAACTAGTTTTAAGTTTCTCCTTCTTCTCTCCTTGTTATCTCTATATTAAATCT
TCGAAATGAATTCTGCAGGGTTTCAATCTGATTTCTATTAGAAAAGAAAAGAAACAAAAAAAAAAAAATATTAGTGTTTGTGATTGGAGGTACCTGTGGA
AGAAATAGTGCAAGTTTTGATTTCTCAGGAATTAAGGATAAAGAAACTTAATTTATTGATCTATCAATTGTTTTCCTCTATCTGAAAGTCTAACAATGAT
TGATCAATTAATTAAATCAAGAGGGCGAAGAGGAGGAATTCCTTGTTTTCATTTCATCAGATCATCTGGCAGTTTCAATCCCTCAATTTCCCAACAGA

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase sbi-MIR167c: 7.0E-9

PMRD vvi-miR167a: 7.0E-9

microPC miR167: 3.0E-5		UniProt no hits

RFAM 1MIR167_1: 1.0E-7		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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