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Species belonging to selected taxon:
Chlamydomonas reinhardtii
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST039353
species:
Chlamydomonas reinhardtii
source:
miRBase, original name:
cre-MIR1160
(
MI0006221
)
Taxonomy by NCBI:
Chlamydomonas reinhardtii
Chlamydomonas
Chlamydomonadaceae
Chlamydomonadales
Chlorophyceae
Chlorophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TTGCCCTTTTTAAGCAGGGC
miRNA*
CCTGCTTAAAAAGGGCAAAG
mismatches:
0
bulges:
0
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pre-miRNA
TTTGCATGCTCTCGCCCGCTACACAAACACGAATGCTCAAACGCTCCCTTCCCGCACGGGTCCTTCCGGCTGCGCCGGTCAAGCCTGC
CCTGCTTAAAAA
GGGCAAAG
TTCGGGCTGACAAGGAAGCAGAGCGGATCCTCCAGAGCCTCACAGACCTCAAGAAGGTCGGGTTCACAAGCAAATGACGCCTGCTTAACCAG
GTCGTTGCCGCCGGAAAAGTCGTCAGCAGCGTGGCAGCCTGCTTAGCAGGCGTCATTTGCTTGTGAACCCGACCTTCTTGAGGTCTGTGAGGCTCTGGAG
GATCCGCTCTGCTTCCTTGTCAGCCCGAACT
TTGCCCTTTTTAAGCAGGGC
AGGCTTGACCGGCGCAGCCGGAAGGACCCGTGCGGGAAGGGAGCGTTTG
AGCATTCGTGTTTGTGTAGCGGGCGAGAGCATGCAGA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
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no hits
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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evidence:
cloned
references
[
1
] Molnar A, Schwach F, Studholme DJ, Thuenemann EC, Baulcombe DC,
Nature. 447:1126-1129(2007).
,
"miRNAs control gene expression in the single-cell alga Chlamydomonas reinhardtii"