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Species belonging to selected taxon:

Oryza sativa



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST004056
species: Oryza sativa
miRNA family: MIRf25
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 GTCCAAACATCCGATGTGATA

miRNA*
 TCACATTGGATGTTTGGACGC

mismatches: 0
bulges: 0
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pre-miRNA
 AAAGTACATGTCACATTGGATGTTTGGACGCTAATTTGAAGTATTAAATATAGACTAATAAAAAAACTAATTTCATAAATGCGAGCTAATCTGCGAGACG
AATTTTTTAAGCCTAATTAATCTATAATTATGAAAAGTTTACTGTAGCATCACATTGTCAAATCATGGCGTAATTAGACTCAAAAGATTCGTCTCGCGAA
TTAGTCCAAGGTTATGGAATGGGTTTTGTAATTAGTGTATGTTTAATACTCTAAATTAGTGTCCAAACATCCGATGTGATAGGGACTT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase osa-MIR445a: 5e-104

PMRD osa-miR445a: 5e-104

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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