ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
source: microPC, original name: miR159
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTCTA miRNA* GAGCTCCTTAAAGTCCAATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
TGGAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTT
TTCAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTCTA
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 3e-27 PMRD vvi-miR159c: 8e-22 microPC miR159: 3e-95 | UniProt no hits RFAM MIR159: 6e-26 |
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