ABOUT THIS RECORDspecies: Manihot esculenta
source: microPC, original name: miR319
Taxonomy by NCBI:
Manihot esculenta Manihot Manihoteae Crotonoideae Euphorbiaceae Malpighiales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGATTGAAGGGAGCTC miRNA* GCTCCTTAAAGTCCAATA mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
GAGCTCCTTAAAGTCCAATAGAGGATCTTGCAGGGTAGATTGAGCTGCTGAGCTATGGATACCACAGCCCTATCCCATAATAAAAGGGAGTTCTTTTTTT
CAAGTCTTCTTGGATAGGCTTGTGGCTTGCATATCTCTGGAGCTTCATTACCTTATTATGTTAGATCCTTGTTTGGATTGAAGGGAGCTC
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase rco-MIR159: 5e-26 PMRD vvi-miR159c: 1e-20 microPC miR319: 7e-93 | UniProt no hits RFAM MIR159: 9e-25 |
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