ABOUT THIS RECORDspecies: Oryza sativa
miRNA family: MIR806
source: PMRD, original name: osa-miR806d
Taxonomy by NCBI:
Oryza sativa Oryza Oryzeae Ehrhartoideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTGCTAAAAAGTCAACGGTG miRNA* CCGTTGAGTTTTTAATACGTGT mismatches: 2 bulges: 0 |
pre-miRNA
CTCCCTCCGTCCGAAATACTCCCTCCTTTCAAAATGTTTGATACCGTTGAGTTTTTAATACGTGTTTGACCATTCGTTTTATTCAAAAAATTTAAATAAT
TATTTATTCTTTTCATATCATTTGATTCATTGTTAAATATACTTTCATATGCACATATAGTTTTACATATTTCACAATTTTTTTAGAATAAGACTAACGG
TCAAACATGTGCTAAAAAGTCAACGGTGTCAAACATTTTAAAACGGAGGGAGTATAAGGGATTTTAGGTGG
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[1] Luo YC, Zhou H, Li Y, Chen JY, Yang JH, Chen YQ, Qu LH, FEBS Lett. 580:5111-5116(2006)., "Rice embryogenic calli express a unique set of microRNAs, suggesting regulatory roles of microRNAs in plant post-embryogenic development"
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR806d: 5e-141 PMRD osa-miR806g: 5e-76 microPC miR806: 8e-38 | UniProt no hits RFAM MIR806: 6e-76 |
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[1] Luo YC, Zhou H, Li Y, Chen JY, Yang JH, Chen YQ, Qu LH, FEBS Lett. 580:5111-5116(2006)., "Rice embryogenic calli express a unique set of microRNAs, suggesting regulatory roles of microRNAs in plant post-embryogenic development"
