ABOUT THIS RECORDspecies: Mus musculus
miRNA family: let-7
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Mus musculus Mus Mus Murinae Muridae Muroidea Sciurognathi Rodentia Glires Euarchontoglires Eutheria Theria Mammalia Amniota Tetrapoda Sarcopterygii Euteleostomi Teleostomi Gnathostomata Vertebrata Craniata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGAGTTAGTGGGTTGTATCAG miRNA* GTAATGGCCCCAACTCCAG mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
AGCGAGAATCAGCACGTGTGTTTACATCACGTCTTGTTGTAATGGCCCCAACTCCAGAGTGTTGCCACACTTATTTATGTATATNTATAGCTCTGCTAGC
TGTGAGNTTCTAACAGCATCTACCCGACATGCACAGCTGCTGAGCCTGTTTGAGTTAGTGGGTTGTATCAGAGGTGATGTGTAGTAGTTATGACTTGTTG
ACATTA
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
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AGCGAGAATCAGCACGTGTGTTTACATCACGTCTTGTTGTAATGGCCCCAACTCCAGAGTGTTGCCACACTTATTTATGTATATNTATAGCTCTGCTAGC
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ACATTA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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