ABOUT THIS RECORDspecies: Dioscorea alata
miRNA family: MIRf264
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Dioscorea alata Dioscorea Dioscoreaceae Dioscoreales Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TCGAACCCGAACCCGAACCCG miRNA* GGTTCGGGTTCGGGTCGGGT mismatches: 0 bulges: 1 |
pre-miRNA
CGCTCTCATACTCGAACCCGAACCCGAACCCGAACCTGACGGGTTTTCAAAACCCCAACCCACATCCTCACATGAAAATAAAACATTTAAACCAGTACAA
AATAGACAAATTCAACGCCGTAGAGTGGGAATTTAAAAACACTAATAAAAAATTGAATATGTACAATTGGGTATATTTGTTAATTGAATTTCTGATCGAG
TTTGGGTTCGGGTTCGGGTCGGGTATCAGGAT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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