ABOUT THIS RECORDspecies: Pinus taeda
miRNA family: miR3710
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Pinus taeda Pinus Pinus Pinaceae Coniferales Coniferopsida Coniferophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGGGAACCTGTCGGGCCTCCA miRNA* GGGAACCTGTCGGGACTCCAAA mismatches: 4 bulges: 1 |
pre-miRNA
TGCAGACGCTACCAGAGTCGATTGGGAACCTGTCGGGCCTCCACAGGCTTAACTTGAGATGCTGCTCCAGTCTGCAGACACTCCCAGACTCAGTGGGGAAC
CTGTCGGGCCTCCAAAGTCTTGACTTGAGCGGGTGCTCCAGTCTGCAGACACTTCCAGACTCATTGGGGAACCTGTCGGGCCTCCAAAGTCTTAACTTGA
GCTACTGCTTCTATCTGCAGACACTCCCAGAATCAGTGGGGAACCTGTCGGGACTCCAAAATCTTGACTTGAGGTGGT
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pta-MIR1315: 4.0E-15 PMRD pta-miR1315: 4.0E-15 microPC no hits | UniProt sp|O23530|SNC1_ARATH: 3.0E-9 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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