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Species belonging to selected taxon:

Fagus sylvatica



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST000633
species: Fagus sylvatica
miRNA family: MIR414
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Fagus sylvatica Fagus Fagaceae Fagales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
 TCATCATCATCATCATCGTCA

miRNA*
 ACGATGATGATGATGATGATG

mismatches: 0
bulges: 0
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pre-miRNA
 GAGAAAGAGAGGCGGCGATCATGACGATGATGATGATGATGATGATGGCCCAGCAACGAGCAGCAGCTCGAGTGCAACTACAAAGGGATACGATATTAAC
AAGCGACAGAAGACTGGGAGTACGAGTGCGAGTAGCTCTGGAGAGCAAAAGGAGGAATCGAAGGAGGAGGATGCGACAATGAAAGATGCCGCAGCCAGCA
GCACGATCAAGCAACAATCATCTCCTCAGCCACAGCTGTATCACAAGCAGCGAAGTGCTGCCAATGCAGAGAAGATGGGTGATTTCTCTTCTCACATCTG
TCTCAAACTATCAAATGCATACCAGAAATCACAAGTAGCAGCGGCTGCGGCATCTTTCATTGTCTCGTCCTCCGCCTTCGATTCCTCCTTTTGCTCTCCA
GAGCTACTCGCACTCGTACTCCCAGTCTTCTGTCGCTTGTTAATATCGTATCCCTTTGTAGTTGCACTCGAGCTGCTGCTCGTTGCTGGGCCATCATCAT
CATCATCATCATCGTCATGATCGCCGGCTCTCTTTCT

dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

microPC no hits		UniProt no hits

RFAM no hits		most similar mature miRNAs

MORE

miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
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