ABOUT THIS RECORDspecies: Festuca pratensis
miRNA family: MIR1122
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Festuca pratensis Festuca Loliinae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TACTCCCTCCGTGCAACAAAA miRNA* TTTTTGCATGGAGTTAAGATATT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
ACAGTTTGTTTCTTTTTGCATGGAGTTAAGATATTTCATTCACATATTTAAATGATTTTAAGAGGTACATAAGCAATTGAAGAGGAAGACGACGTCCAATG
GCCCAACGATTGCTGTCGCGAAGAAGGAAGCTCATGTTTCCGGGTTCCGCCAGGAGCTCCACAAGGAGGTTTCTGGTCGCCTGCCCTATTTACTATGTAG
CTAACTTTTACTGCCCTTGCTTTGAAATTGTTTATTTGTAATTCAGTATAGGTGTTGATCTTGGAATACTCCCTCCGTGCAACAAAAGATGTCTCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD bsy-miR1122: 3.0E-7 microPC no hits | UniProt no hits RFAM 2MIR1122: 5.0E-6 | most similar mature miRNAs |
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