ABOUT THIS RECORDspecies: Festuca pratensis
miRNA family: MIR2504
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Festuca pratensis Festuca Loliinae Poeae Pooideae BEP clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGACCAAGCTTATAGAAAAA miRNA* TTTCTAAAGACTTGGTCAATT mismatches: 0 bulges: 2 |
pre-miRNA
TTCTTTGTTACTACTTCTGTTCCGTGATATAAAGGCGTATAATTTTTTCCTGAAGTCAAACGATGTAGAGTTTGACCAAGCTTATAGAAAAATCTATTGA
GAACTATGATACTATATAGATATAATATGAACATGTATGTCATGATGTATCTAATTAAATTGATTTACCATGATAGTAGTTTTTTCTAAAGACTTGGTCA
ATTTTTTCATAATTTGACTTTTGAAAAAATGTATACGCCTTATTTTATGGAACGGAGGTAGTACTGTTTTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase osa-MIR437: 0.0009 PMRD bdi-miR2504b: 0.00001 microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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