ABOUT THIS RECORDspecies: Ictalurus punctatus
miRNA family: mir-1322
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Ictalurus punctatus Ictalurus Ictaluridae Siluriformes Siluriphysi Otophysi Ostariophysi Otocephala Clupeocephala Elopocephala Teleostei Neopterygii Actinopteri Actinopterygii Euteleostomi Teleostomi Gnathostomata Vertebrata Craniata Chordata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GATGCTGCTGCTGCTGCTGCT miRNA* CTGTAGCCGTAGTGCATCAC mismatches: 2 bulges: 1 |
pre-miRNA
GCCATCGGCGAGCTGTAGCCGTAGTGCATCACCTGCTCGTACGTTTTCAGGTCCATTTTGTGGTGATGCTGCTGCTCGGACGACATAAGGTTGTTGATGG
AGAACGGGTGGTTGAAAGCGTAGTGGTGATCTGGCTTCAAGTGCGCGTCGTGCGCAAGAACCGCGTGGTGCTGCGCCATTAGATGCTGCTGCTGCTGCTG
CTGTTGGTGGT
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt sp|Q07342|FOXA2_DANRE: 2e-20 RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
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