ABOUT THIS RECORDspecies: Gossypium hirsutum
miRNA family: MIRf598
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Gossypium hirsutum Gossypium Malvoideae Malvaceae Malvales malvids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTTGGCTTGGCAATCACACAA miRNA* GCGGATTGGCCAAGTTAATGA mismatches: 3 bulges: 2 |
pre-miRNA
AGGCCGTGGATCCTGGTTTCCTTTGGCTTGGCAATCACACAACATGAATCTTTTGGCCGCTCCACCTCCTTTGGGGCAGCAAAATGCTAATCCTCTATTC
ATAAACTCTGGCACTAAGATGGTCTCCACCAGGGGGACTTTGCCGGTGGATGGATATCATGATTTACCTCACTTGCGGATTGGCCAAGTTAATGAACCCC
AGGGCTGGTTTCA
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: not a miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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