ABOUT THIS RECORDspecies: Paracentrotus lividus
miRNA family: miR-705
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Paracentrotus lividus Paracentrotus Echinidae Echinoida Echinacea Euechinoidea Echinoidea Echinozoa Eleutherozoa Echinodermata Deuterostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA GGTGGGAGGTGGTGTGGTTGT miRNA* AGTCGTGCTGCTTCCCACTGA mismatches: 0 bulges: 0 |
pre-miRNA
CCATGGACCGGGTTTTGTCGGTGGGAGGTGGTGTGGTTGTACATTGCAGAAGTGTATTGGCTGCACTTCCCCCACTATTTTTTGTCAGCTAATGTGTTTT
TGCAATGTGCAGTCGTGCTGCTTCCCACTGACAGAATTTGGTCCGTG
dot-bracket secondary structure
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miRNEST target predictions: none
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HuntMi prediction: true miRNA
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CCATGGACCGGGTTTTGTCGGTGGGAGGTGGTGTGGTTGTACATTGCAGAAGTGTATTGGCTGCACTTCCCCCACTATTTTTTGTCAGCTAATGTGTTTT
TGCAATGTGCAGTCGTGCTGCTTCCCACTGACAGAATTTGGTCCGTG
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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