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Species belonging to selected taxon:

Sorghum bicolor



ABOUT THIS RECORD

ID: MNEST008472
species: Sorghum bicolor
miRNA family: MIR156
source: miRNEST

Taxonomy by NCBI:
Sorghum bicolor Sorghum Andropogoneae Panicoideae PACCAD clade Poaceae Poales commelinids Liliopsida Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms






SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
TGACAGAAGAGAGGGATCAGG

miRNA*
TTTTTTTTTTTCTTTTGTAATT

mismatches: 3
bulges: 1

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pre-miRNA
GTTTAGTTGCATTGTTAACTACAAAACGAGGTGACAGAAGAGAGGGATCAGGTGGTGATTGTGGGCAAAGCTGATTTGATTAGCACAGGGGCAGCAGACT
GACTTTAGAATTGGCAGCAAAGGAAGTGGCTGGCTAATCGATTCTTTTGTGCAGCAGGGCCTCCAATTTGAGGCCTCTGGGGGCACGCTTAGAAGACACA
CACGTAACAATATTCTTGTTGCTGGAGGTTCCGTGTCACTGCCGGTGGCTCTTTGATGCCTGGCTGTCAGTGGCAGAAAATTAAAGAGAACCTCGCTACT
TTGATTTATCTGCAAGTGTTTAGAGCATGTAGCTAGCTTAGCTGTATATCTCTCTCACTTTGCCTACGGCCTTTCCTTTTTTTTTTTCTTTTGTAATTTC
CTGTAAACAGGCGTAGCTGCTACACT


dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase no hits

PMRD no hits

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UniProt no hits

RFAM no hits
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miRNEST target predictions
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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