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Species belonging to selected taxon:
Brassica napus
,
Brassica oleracea var. alboglabra
,
Brassica rapa
,
Brassica oleracea
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST008670
species:
Brassica oleracea
miRNA family:
miR824
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Brassica oleracea
Brassica
Brassicaceae
Brassicales
malvids
rosids
core eudicotyledons
eudicotyledons
Magnoliophyta
Spermatophyta
Euphyllophyta
Tracheophyta
Embryophyta
Streptophytina
Streptophyta
Viridiplantae
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
CCTTCTCATCGATGGTCTAGA
miRNA*
TAGACCATTTGTGAGAAGGGA
mismatches:
1
bulges:
0
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pre-miRNA
TGTCTTTCATGTC
TAGACCATTTGTGAGAAGGGA
TTTTTTGTTTGCACCGTTCACCCCACTTTCAATCTGTAGTGAGTATTAAGGAAAATAGCTTGTTCA
ACATATCACACTACTCTTTTAGAAACAATACTATATTTTAGATGCTTTTCCAGCTTGATATACGTTGTTTTGTTATGTATATCTGTATTATCCCGGCTAC
CAAAACGTTAAGAAATAAGGTGAACATCCTAAAACCTGCATCCAATTAGAAAGGTCTAGGTCACAGATATTACTTGTTATCTCTTGATTAAGCTATTTTA
TTTCTATCAGCATGATCAGATCATTCAGGAGTTAAGTATAAACTAAAATACATTAAGTCCATTCATGACATTTCTGGATGCTGCATACATAATATTTTCC
TTGTTTTTGGACTATGCCACACTTCGGACAGACATTTTGCCTAAGAGATGTCAAACCTCTGTCTGGAGTGTTAGAGGTATTTCATGATAGCTAAGAACTT
GAATCTTGCACTACTTAGCTACACTAGATTACTTCATAGTAAATAACTTGGGGAGTGGGGGAAGGTGCTGGGTTATTATTC
CCTTCTCATCGATGGTCTA
GA
TGTGCGAGGT
dot-bracket secondary structure
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SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
bol-miR824
:
0
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
MIR824: 0
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
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