ABOUT THIS RECORDspecies: Phaseolus vulgaris
miRNA family: MIR319
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Phaseolus vulgaris Phaseolus Phaseoleae Papilionoideae Fabaceae Fabales fabids rosids core eudicotyledons eudicotyledons Magnoliophyta Spermatophyta Euphyllophyta Tracheophyta Embryophyta Streptophytina Streptophyta Viridiplantae Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TTGGACTGAAGGGAGCTCCTT miRNA* GGAGCTTCCCTCAGCCCATTC mismatches: 3 bulges: 0 |
pre-miRNA
AGAGAGTGAAGGAGCTTCCCTCAGCCCATTCATGGATACAAAAGATTGGGTTGCAAAATTAACCACTAACTCATTCACACAATAGTATTCAGTTAGGGTG
ATGCTCTTTTTGCTATAATATGATTGTGTGAATGAAGTGATGCATACATATTGTGTGACCCTCTTTCTCTGAGCTTGGACTGAAGGGAGCTCCTTCTTTC
TG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase pvu-MIR319c: 2e-112 PMRD pvu-miR319c: 2e-112 microPC miR319: 1e-103 | UniProt no hits RFAM MIR159: 0.000000000003 | most similar mature miRNAs |
Identical with: miR319 from microPC (MNEST046580) |
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