miRNEST 2.0, an integrative microRNA resource :: Browse
Home
Browse miRNAs
Deep-seq predictions
Mirtrons
miRNA genes
Degradomes
Download
Upload
Contact
Species belonging to selected taxon:
Bicyclus anynana
,
Acropora millepora
,
Mus musculus
,
Sus scrofa
,
Bos taurus
,
Danio rerio
,
Ciona intestinalis
,
Rattus norvegicus
,
Drosophila melanogaster
,
Xenopus laevis
,
Oryzias latipes
,
Gallus gallus
,
Salmo salar
,
Caenorhabditis elegans
,
Canis lupus familiaris
,
Ictalurus punctatus
,
Ovis aries
,
Branchiostoma floridae
,
Bombyx mori
,
Aedes aegypti
,
Oncorhynchus mykiss
,
Gasterosteus aculeatus
,
Pimephales promelas
,
Aplysia californica
,
Lottia gigantea
,
Gadus morhua
,
Alvinella pompejana
,
Schistosoma mansoni
,
Ixodes scapularis
,
Hydra vulgaris
,
Macaca fascicularis
,
Litopenaeus vannamei
,
Anolis carolinensis
,
Trichosurus vulpecula
,
Papio anubis
,
Paracentrotus lividus
,
Ictalurus furcatus
,
Lepeophtheirus salmonis
,
Homo sapiens
,
Acyrthosiphon pisum
,
Culex quinquefasciatus
,
Saccoglossus kowalevskii
,
Nematostella vectensis
,
Anopheles gambiae
,
Dendroctonus ponderosae
,
Daphnia pulex
,
Nasonia vitripennis
,
Strongylocentrotus purpuratus
,
Petromyzon marinus
,
Drosophila simulans
,
Oreochromis niloticus
,
Molgula tectiformis
,
Schistosoma japonicum
,
Helobdella robusta
,
Petrolisthes cinctipes
,
Taeniopygia guttata
,
Aphis gossypii
,
Clytia hemisphaerica
,
Ciona savignyi
,
Ancylostoma caninum
,
Tetranychus urticae
,
Glossina morsitans morsitans
,
Peromyscus maniculatus bairdii
,
Fundulus heteroclitus
,
Choristoneura fumiferana
,
Sparus aurata
,
Spodoptera frugiperda
,
Amphimedon queenslandica
,
Halocynthia roretzi
,
Heliothis virescens
,
Crassostrea gigas
,
Patiria pectinifera
,
Ascaris suum
,
Dicentrarchus labrax
,
Biomphalaria glabrata
,
Heterorhabditis bacteriophora
,
Rhipicephalus microplus
,
Brachionus plicatilis
,
Pongo abelii
,
Locusta migratoria
,
Acropora palmata
,
Phlebotomus papatasi
,
Mytilus californianus
,
Anemonia viridis
,
Penaeus monodon
,
Ursus americanus
,
Drosophila sechellia
,
Drosophila auraria
,
Artemia franciscana
,
Pristionchus pacificus
,
Nilaparvata lugens
,
Equus caballus
,
Dissostichus mawsoni
,
Osmerus mordax
,
Euprymna scolopes
,
Pleurobrachia pileus
,
Antheraea assama
,
Drosophila pseudoobscura
,
Oryctolagus cuniculus
,
Macaca nemestrina
,
Anoplopoma fimbria
,
Cyprinus carpio
,
Teleopsis dalmanni
,
Montastraea faveolata
,
Lutzomyia longipalpis
,
Caenorhabditis japonica
,
Esox lucius
,
Squalus acanthias
,
Caligus rogercresseyi
,
Leucoraja erinacea
,
Taenia solium
,
Nasonia giraulti
,
Homarus americanus
,
Caenorhabditis brenneri
,
Bombus terrestris
,
Metridium senile
,
Rana catesbeiana
,
Myzus persicae
,
Strongyloides ratti
,
Drosophila willistoni
,
Brugia malayi
,
Takifugu rubripes
,
Cynops pyrrhogaster
,
Trichinella spiralis
,
Meloidogyne hapla
,
Heterodera glycines
,
Eptatretus burgeri
,
Sebastes caurinus
,
Drosophila ananassae
,
Solenopsis invicta
,
Drosophila virilis
,
Drosophila erecta
,
Misgurnus anguillicaudatus
,
Perca flavescens
,
Paralabidochromis chilotes
,
Drosophila grimshawi
,
Ceratitis capitata
,
Hippoglossus hippoglossus
,
Spodoptera littoralis
,
Peregrinus maidis
,
Ambystoma tigrinum tigrinum
,
Meloidogyne incognita
,
Caenorhabditis remanei
,
Samia cynthia ricini
,
Lumbricus rubellus
,
Cavia porcellus
,
Drosophila mojavensis
,
Danaus plexippus
,
Bos indicus
,
Rhipicephalus appendiculatus
,
Cochliomyia hominivorax
,
Rutilus rutilus
,
Anopheles stephensi
,
Diabrotica virgifera virgifera
,
Meleagris gallopavo
,
Trichinella pseudospiralis
,
Tubifex tubifex
,
Haematobia irritans irritans
,
Eriocheir sinensis
,
Papilio xuthus
,
Onychiurus arcticus
,
Lonchura striata domestica
,
Poecilia reticulata
,
Mnemiopsis leidyi
,
Rhodnius prolixus
,
Carcinus maenas
,
Bos sp.
,
Polypedilum vanderplanki
,
Onchocerca volvulus
,
Ostrinia nubilalis
,
Lernaeocera branchialis
,
Macropus eugenii
,
Caligus clemensi
,
Peromyscus polionotus subgriseus
,
Nippostrongylus brasiliensis
,
Laupala kohalensis
,
Oncorhynchus tshawytscha
,
Frankliniella occidentalis
,
Capra hircus
,
Daphnia magna
,
Suberites domuncula
,
Paralichthys olivaceus
,
Psetta maxima
,
Gammarus pulex
,
Trichoplusia ni
,
Meloidogyne chitwoodi
,
Pan troglodytes verus
,
Spadella cephaloptera
,
Globodera rostochiensis
,
Lymnaea stagnalis
,
Lates calcarifer
,
Porites astreoides
,
Calanus finmarchicus
,
Strongyloides stercoralis
,
Oncorhynchus nerka
,
Gryllus bimaculatus
,
Sebastes rastrelliger
,
Oscarella carmela
,
Drosophila yakuba
,
Thymallus thymallus
,
Ancylostoma ceylanicum
,
Solea senegalensis
,
Epiphyas postvittana
,
Callinectes sapidus
,
Peripatopsis sedgwicki
,
Fenneropenaeus chinensis
,
Coregonus clupeaformis
,
Aiptasia pallida
,
Torpedo californica
,
Thunnus thynnus
,
Cynoglossus semilaevis
,
Salvelinus fontinalis
,
Schmidtea mediterranea
,
Apis mellifera
,
Tribolium castaneum
,
Macaca mulatta
ABOUT THIS RECORD
ID:
MNEST009123
species:
Biomphalaria glabrata
miRNA family:
miR-2035
source:
miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Biomphalaria glabrata
Biomphalaria
Planorbidae
Lymnaeoidea
Basommatophora
Pulmonata
Gastropoda
Mollusca
Protostomia
Coelomata
Bilateria
Eumetazoa
Metazoa
Fungi/Metazoa group
Eukaryota
cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE
miRNA
ACATGTTCTGTTACAAGGTAA
miRNA*
ACTTTGAAAGGAATACATTA
mismatches:
4
bulges:
1
View larger
pre-miRNA
GCCAGTATTGA
ACATGTTCTGTTACAAGGTAA
GAAGAAATGGTGATAGGCTGTGAGTTGAAAAACACAACGGTGAACTCTCTCTGGGGTTTTAGTT
ACTT
TGAAAGGAATACATTA
ATAAAAAA
dot-bracket secondary structure
.....((((((
...((((((.((.((((((((
.((((..(((.((.(((((((..(((....)))...)))))...)).)).)))...))))..))
))))
)))).))))))..)))
))).....
SIMILARITIES
miRBase
no hits
PMRD
no hits
microPC
no hits
UniProt
no hits
RFAM
no hits
most similar mature miRNAs
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction:
true miRNA
Source sequences
download this record