ABOUT THIS RECORDspecies: Homarus americanus
miRNA family: miR-4117
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Homarus americanus Homarus Nephropidae Nephropoidea Astacidea Pleocyemata Decapoda Eucarida Eumalacostraca Malacostraca Crustacea Pancrustacea Mandibulata Arthropoda Panarthropoda Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA TGTGTGAATGTATTGGAGATT miRNA* TCTCTGAGCAATGGTTGAATTTT mismatches: 4 bulges: 2 |
pre-miRNA
AAACACAGCTAATCTCTGAGCAATGGTTGAATTTTATTTTAGCAGTTGTGCTGGATGTAGTTCAGTGGACATTTAATTTCATTTGGTTAAAGGCTCCTTT
GTATCAAGTAAAACTTAAAGCAAATCAGTGCACTGTTGTAAATATTGTGTGAATGTATTGGAGATTATTGGCTAG
dot-bracket secondary structure
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non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
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SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
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