ABOUT THIS RECORDspecies: Lumbricus rubellus
miRNA family: mir-297
source: miRNEST
Taxonomy by NCBI:
Lumbricus rubellus Lumbricus Lumbricidae Lumbricina Haplotaxida Oligochaeta Clitellata Annelida Annelida/Echiura/Pogonophora group Protostomia Coelomata Bilateria Eumetazoa Metazoa Fungi/Metazoa group Eukaryota cellular organisms
SEQUENCE & STRUCTURE| miRNA ATGTATGTGTGTATGTAGGCC miRNA* TCTGCGTACATGTATGTTT mismatches: 1 bulges: 2 |
pre-miRNA
GCCAAAGTTACAGTTTAGATCTGCGTACATGTATGTTTATGTATGTATGTATACTATGTATGTATACTATGTATGTGCGTGTATGTATGTGTGTATGTAG
GCCTATCACTGTGGCTATG
dot-bracket secondary structure
..((.(((((((((.(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((.......))))))...))))))))))).))))))..))))))))))
).)))..))))))))).))
SIMILARITIES
MORE
miRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
GCCAAAGTTACAGTTTAGATCTGCGTACATGTATGTTTATGTATGTATGTATACTATGTATGTATACTATGTATGTGCGTGTATGTATGTGTGTATGTAG
GCCTATCACTGTGGCTATG
dot-bracket secondary structure
..((.(((((((((.(((.(((((((((((((((((.(((((((((((((((((.......))))))...))))))))))).))))))..))))))))))
).)))..))))))))).))
SIMILARITIES| miRBase no hits PMRD no hits microPC no hits | UniProt no hits RFAM no hits | most similar mature miRNAs |
MOREmiRNEST target predictions: none
non-miRNEST targets: none
HuntMi prediction: true miRNA
Source sequences
download this record
